DNA metabarcoding reveals fine scale geographical differences of consumed algae in the Galápagos marine iguanas (Amblyrhynchus cristatus)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Galápagos marine iguanas are primarily associated with the marine environment and show special nutritional adaptations. They are the only lizards worldwide that forage on marine macroalgae. Until now, consumed algae have been identified by direct observations during their feeding activities and microscopic identification in faeces samples. In this study, we use a novel DNA metabarcoding approach to identify consumed algal species from the faeces of marine iguanas. We developed primers for the ribulose-bisphosphate carboxylase (rbcL) gene and applied a metabarcoding approach to 25 individual faeces samples collected in four representative sites of two subspecies ( Amblyrhynchus cristatus mertensi and A. c. godzilla ), found in the San Cristóbal Island. We detected 18 consistently occurring macroalgal operational taxonomic units (OTUs). Most of the OTUs were assigned to Rhodophyta (red algae) and only one OTU to Chlorophyta (green algae). Despite the number of consumed algal species did not differ between two subspecies (OTU richness; P = 0.383), diet overlap level between A. c. mertensi and A. c. godzilla was low (Schoener index = 0.345), suggesting that both subspecies consumed different algal species in their natural environment. Further studies are needed to understand whether the difference of consumed algae reflects disparities in the abundance of algal species between sites, or whether iguanas of the two genetically differentiated subspecies prefer distinct algal species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».