Additional file 1 of Utilizing two-dimensional monolayer and three-dimensional spheroids to enhance radiotherapeutic potential by combining gold nanoparticles and docetaxel
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1. Figure S1. Characterizing spheroid size and gold nanoparticle stability. (a) Size of the spheroids for HeLa and LNCaP under different initial cell count conditions. An approximate size of 300-400 μm was used for all experiments. (b) Brightfield images of the spheroids under different initial cell counts, scale bar is 250 μm. (c) Gold nanoparticles conjugated with polyethylene glycol and a peptide containing integrin binding domain RGD is stable after 2 months while stored at 4 °C. Figure S2. Docetaxel characterization in LNCaP. (a,b) Proliferation assays for a (a) two-dimensional monolayer and a (b) three-dimensional spheroid, for the prostate cancer cell line LNCaP, treated with docetaxel. (c,d) Cell cycle analysis of a (c) monolayer and (d) spheroids of LNCaP cells treated with the GR50 dose of docetaxel, calculated per modality. Figure S3. Darkfield images of monolayer and spheroids. (a,b) Darkfield images of a monolayer of HeLa (a) without and (b) with docetaxel. Cells with multinucleated cells due to docetaxel have been circled in red on (b). Scale bar is 40 μm. (c,d) Darkfield images of 10 μm sections of HeLa spheroids (c) without and (d) with docetaxel. Inset is hyper spectral spectrum of cells. Scale bar is 40 μm. Figure S4. Confocal images of 53BP1 foci in monolayer of HeLa. Images of HeLa nuclei 24 hours after being irradiated with 2 Gy, 5 Gy, and 10 Gy. Samples include untreated, docetaxel treated, gold nanoparticle treated, and combined docetaxel and gold nanoparticle treatment. Nuclei and 53BP1 foci are marked in blue and green, respectively. Scale bar is 25 μm. Figure S5. Confocal images of 53BP1 foci in monolayer of LNCaP. Images of LNCaP nuclei 24 hours after being irradiated with 2 Gy, 5 Gy, and 10 Gy. Samples include untreated, docetaxel treated, gold nanoparticle treated, and combined docetaxel and gold nanoparticle treatment. Nuclei and 53BP1 foci are marked in blue and green, respectively. Scale bar is 25 μm. Figure S6. Hypoxia analysis in spheroids. (a,b) Analysis of hypoxic core in spheroids of (a) experimental size (diameter ≈300–400 μm) and (b) spheroids of diameter > 600 μm. Due to radiations ability to create reactive oxygen species, a core that is normoxic is desirable to do more damage to all the cells. Scale bar is 300 μm. Figure S7. Growth of LNCaP spheroids following radiation. Brightfield images of LNCaP spheroids that have been untreated, treated with docetaxel, treated with gold nanoparticles, and treated with docetaxel and gold nanoparticles, and then radiated with 2 Gy, 5 Gy, and 10 Gy. Scale bar is 100 μm.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,022 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,879 | 0,152 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».