Additional file 5 of PD-1 blockade delays tumor growth by inhibiting an intrinsic SHP2/Ras/MAPK signalling in thyroid cancer cells
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 5: Supplementary Figure 4. Effects of intrinsic PD-1 on SHP2 localization and functions. A. Expression levels of PD-1, phospho-PD-1, SHP2 and phospho-SHP2 in 8505c and TPC-1 cells transiently transfected with pFLAG PD-1 or the empty vector pFLAG, assessed by western blot. A representative experiment is shown. B. Immunofluorescence microscopy of 8505c cells, transiently transfected with pFLAG PD-1 or the empty vector, with antibody specific for SHP2. Arrows indicate the surface signal of SHP2. Bars, 5 μm. A representative experiment is shown. C. Immunofluorescence microscopy of 8505c cells transiently transfected with pCMV6 PD-1-GFP and stained with antibody specific for SHP2, and the merged signal. Arrows indicate the surface signal of SHP2. Bars, 5 μm. A representative experiment is shown. D. Total protein extracts from TPC-1 cells transiently transfected with pFLAG-PD-1 or the empty vector pFLAG were subjected to a pull-down assay using the indicated recombinant proteins or to immunoprecipitation using the indicated antibodies. Proteins were immunoblotted with antibody against SHP2 or GRB2. A representative experiment is shown. E. Total cell protein extracts from 8505c cells transiently transfected with combination of pCEFL H-Ras AU5, pFLAG PD-1 or empty vector (pFLAG + pCEFL) were subjected to immunoprecipitation with anti-phospho tyrosine followed by western blotting with pan (RAS) antibody. A representative experiment is shown, together with the mean densitometric analysis ± SD of 5 independent assays. * P<0.05 compared to the relative control.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,016 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,886 | 0,175 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».