Additional file 1 of Glucocorticoid agonists enhance retinal stem cell self-renewal and proliferation
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Figure S1. Visual confirmation that glucocorticoid agonists enhanced retinal stem and progenitor yield and was not due to artifacts. Images from the Celigo imaging cytometer showing 96-well plate wells at the end of a 7-day growth assay. Wells were treated with the indicated glucocorticoid agonist compounds. The nuclear channel, the GFP channel and merge demonstrate the ability to differentiate Hoechst and actin-GFP double-positive objects from debris and other artifacts that appear only in the nuclear channel. Visually, it is apparent dexamethasone and prednisolone have greater signal than the other conditions. Red arrows indicate artifacts that fluoresce in the blue nuclear channel that do not fluoresce in the GFP channel. 4x magnification. Figure S2. Representative staining of cell death marker ethidium homodimer (EthD-1) and thymidine analog EdU. (A-B) EthD-1 labeling at Day 2 in cells treated with (A) 0.1% DMSO, or (B) 1μM Dexamethasone. (C-D) EdU labeling at Day 4 in cells treated with (A) 0.1% DMSO, or (B) 1μM Dexamethasone. Figure S3. Intravitreal dexamethasone injection induces ciliary epithelium proliferation. (A-B) Representative images of Pax6 IHC and EdU labeling in the ciliary body of mouse eyes exposed to (A) 0.5% DMSO vehicle, or (B) 10μM Dexamethasone. Nuclei are labeled via Hoechst staining. White arrows indicate Pax6 + EdU co-labeled cells. Dashed line indicates inset. 10 μm-thick sections. Figure S4. EdU-positive cells co-label with endothelial and microglia/macrophage markers. (A-B) Representative images of ERG IHC and EdU labeling in the ciliary body of mouse eyes exposed to (A) 0.5% DMSO vehicle, or (B) 10μM Dexamethasone. (C-D) Representative images of CD68 IHC and EdU labeling in the ciliary body of mouse eyes exposed to (C) 0.5% DMSO vehicle, or (D) 10μM Dexamethasone. Nuclei are labeled via Hoechst staining. White arrows indicate co-labeled cells. 10 μm-thick sections. Figure S5. Glucocorticoid receptor, Mineralocorticoid receptor, and 11-β-HSD1 & 2 RNA expression in RSC spheres. Transcriptomic data showing the expression of the glucocorticoid receptor (Nr3c1), mineralocorticoid receptor (Nr3c2) and the two 11-β-HSD isozymes in RSC spheres, supporting the finding of retinal precursor sensitivity to GR agonists. This graph was created from RNAseq data collected in Khalili et al. 2018. Two different mouse strains were used to generate RSC spheres that were lysed and high-quality total RNA (RIN: 9–10) was subjected to directional RNA-sequencing library construction from three independent biological replicates per mouse strain. Sequencing was performed using GAIIx (Illumina, Inc., San Diego, CA; www.illumina.com). Table S1. Compounds that met hit criteria in at least one of two screens. Table S2. Screening quality metrics.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,921 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».