Additional file 1 of Synergistic effects of type I PRMT and PARP inhibitors against non-small cell lung cancer cells
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1. Figure S1. Validation of the drug screen. Graphic showing original data from the screen (plain circle) highest (20) and lowest (20) hits. Results from the validation are labelled with (+) if validation was confirmed or (-) if validation failed. Pie chart summarizes result of validation process; 28 of 40 compounds matched the primary output, leading to a validation rate for the screen of 70%. Figure S2. MS023 and BMN-673 synergy dependency on MTAP in NSCLC cell lines. A) Immunoblotting of SK-LU-1 and HCC4006 cell lines infected with the empty lentivector (pLoc) or pLoc-MTAP. Clones #1 and #2 show the re-expression of MTAP using anti-MTAP antibodies. Antibodies against β-actin were used to show equivalent loading. The molecular mass markers are shown in kDa. B) Same as panel A except the cellular lysates were immunoblotted with anti-SDMA and β-actin antibodies as indicated. C-D) Cell death curves as determined by MTT assay of the SK-LU-1 and HC4006 clones treated with a range of MS023 concentrations. Dotted vertical lines represent IC50 values for each cell line (SK-LU-1: n=5; HCC4006: n=4). Stars (*: p <0.05; **: p <0.01; ***: p <0.001, ****: p <0.0001; two-way ANOVA). E-F) Cell death curves as determined by MTT assay of the SK-LU-1 and HCC4006 clones treated with a range of BMN-673 in combination 10 µM MS023 (SK-LU-1, n=4) or 0.2 µM MS023 (HCC4006, n=6). G-H) Bliss synergy scores calculated for BMN-673 and MS023 combination treatment in SK-LU-1 and HCC4006 cells, respectively. Table 1. Drug screening results. Synergy indexes are shown for the 181 compounds treated in combination with MS023 in A549 cells. Table 2. Drug validation results. Synergy indexes are shown for the 40 compounds (20 highest and 20 lowest hits) treated in combination with MS023 in A549 cells. Validation and screening synergy indexes are shown. Cells colored in grey highlight opposing results between screen and validation results. Overall, the validation rate was at 70% (28/40).
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,012 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,893 | 0,177 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».