Additional file 1 of Sorbicillinoids hyperproduction without affecting the cellulosic enzyme production in Trichoderma reesei JNTR5
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Fig. S1 The digital pictures of the T. reesei RUT-C30 and JNTR5 grown on PDA plates for 5 days. Fig. S2 The Copy numbers of gene Tr 69957 in strain JNTR5 (a) and the FPKM values of gene Tr 69957 in strain RUT-C30 and JNTR5 b. Fig. S3 Photographs taken under 302 nm UV light of the yellow pigments produced by strain JNTR5. The samples were obtained by cultivitating JNTR5 at 28 °C for 96 h with glucose as carbon source. Fig. S4 Confocal images of T. reesei RUT-C30 and JNTR5 observed by fluorescence microscopy by 10 X objective lens at Ex/Em = 488/498-563 nm. The samples were obtained by cultivitating RUT-C30 and JNTR5 at 28 °C for 48 h with glucose as carbon source. Fig. S5 The cellulase/hemicellulase activities of JNTR5. Error bars indicate SDs from three independently cultured replicates. Table S1 Primers used in this study
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,846 | 0,202 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».