Additional file 1 of Molecular drivers of insecticide resistance in the Sahelo-Sudanian populations of a major malaria vector Anopheles coluzzii
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Fig. S1 Sampling sites in the Sahel region of four countries. Fig. S2 Summary of total number of RNAseq reads, distribution of trimmed read length for paired reads, and unpaired read after trimming. Fig S3 Venn diagrams comparing summary of the differentially expressed genes between resistant, unexposedand susceptiblesamples. Fig. S4 Principal component analysis of the 500 most variable genes from all RNAseq experimental arms in the data from the four countries. Fig. S5 A heatmap showing the top 50 overexpressed genes in An. coluzzii populations from the Sahel region of each country. Fig. S6 Revigo Scatter and Table Views of the GO terms over-represented in all comparisonsfor data from the four countries. Fig. S7 Validation of RNA-seq results using qRT-PCR. Fig. S8 Polymorphism analysis of full-length cDNA of CYP6Z2. Fig. S9 Comparative alignment of the GSTe2 5′-UTR fragments from the various haplotypes. Fig. S10 Genetic variability of the GSTe2 5′-UTR fragments. Fig. S11 qRT-PCR validation of the overexpression of GSTe2 and CYP6Z2.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,011 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,850 | 0,134 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».