Additional file 1 of Over supplementation with vitamin B12 alters microbe-host interactions in the gut leading to accelerated Citrobacter rodentium colonization and pathogenesis in mice
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Supplementary Figures S1. DESeq2 differential expression analysis of the microbial community between naïve C3H/HeOuJ mice from the SURV and EPC experiments. Figure S2. Cecal SCFA profiles of naïve C3H/HeOuJ mice from the SURV experiment. Figure S3. DESeq2 differential expression analyses of the active microbial community as determine by cecal metatranscriptomics of C3H/HeOuJ mice. Figure S4. Inflammation biomarkers in naïve C3H/HeOuJ mice from the EPC experiment (n = 8). Figure S5. Inflammation biomarkers in C. rodentium-challenged C3H/HeOuJ from the EPC experiment (n = 8). Figure S6. Spearman’s correlation of the significantly altered immune profiles of colon tissues and microbiota in C3H/HeOuJ mice. Supplementary Tables:Table S1. Real-time qRT-PCR primer list. Table S2. Summary of beta-diversity analyses of microbial communities.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,014 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,849 | 0,143 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».