Etiology-specific incidence and mortality of diarrheal diseases in the African region: a systematic review and meta-analysis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Diarrheal diseases substantially affect public health impact in low- and middle-income countries (LMIC), particularly in Africa, where previous studies have indicated a lack of comprehensive data. With a growing number of primary studies on enteric infections in Africa, this study aimed to estimate the incidence and mortality of diarrheal pathogens across all ages in Africa in the year 2020. We also explored different methodological assumptions to allow comparison with other approaches. Methods Through a systematic review and meta-analysis of data from African LMICs, we estimated the etiology proportions for diarrheal diseases and deaths. We combined the etiology proportions with incidence data collected from a population survey in Africa from 2020 and mortality data from the Global Health Observatory of WHO. Results We estimated 1,008 billion diarrhea cases (95% UI 447 million-1,4 billion) and 515,031 diarrhea deaths (95% UI 248,983-1,007,641) in the African region in 2020. In children under five, enteroaggregative E. coli (EAEC) (44,073 cases per 100,000 people, 95% UI 18,818 − 60,922) and G. lamblia (36,116 cases per 100,000 people, 95% UI 15,245 − 49,961) were the leading causes of illness. Enteroinvasive E. coli (EIEC) (155 deaths per 100,000 people, 95% UI 106.5-252.9) and rotavirus (61.5 deaths per 100,000 people, 95% UI 42.3-100.3) were the primary causes of deaths. For children over five and adults, Salmonella spp. caused the largest number of diarrheal cases in the population of children ≥ 5 and adults (122,090 cases per 100,000 people, 95% UI 51,833 − 168,822), while rotavirus (16.4 deaths per 100,000 people, 95% UI 4.2–36.7) and enteroaggregative E. coli (EAEC) (14.6 deaths per 100,000 people, 95% UI 3.9–32.9) causing the most deaths. Geographically, the highest incidence of diarrhea was in Eastern Africa for children under five (114,389 cases per 100,000 people, 95% UI 34,771 − 172,884) and Central Africa for children over five and adults (117,820 cases per 100,000 people, 95% UI 75,111–157,584). Diarrheal mortality was highest in Western Africa for both children below five and above (children < 5: 194.5 deaths per 100,000 people, 95% UI 120-325.4; children ≥ 5 and above: 33.5 deaths per 100,000 people, 95% UI 12.9–75.1). Conclusion These findings provide new information on the incidence and mortality of sixteen pathogens and highlight the need for surveillance and control of diarrheal infectious diseases in Africa. The cause-specific estimates are crucial for prioritizing diarrheal disease prevention in the region.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,012 | 0,031 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,016 | 0,042 |
| Bibliométrie | 0,008 | 0,009 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».