Additional file 1 of Reduction of phenolics in faba bean meal using recombinantly produced and purified Bacillus ligniniphilus catechol 2,3-dioxygenase
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Figure S1. Purification of BLC23O by size-exclusion chromatography. A) Size-exclusion chromatography (SEC) was performed with a HiLoad16/600 Superdex200 column attached to an FPLC system and run at a flowrate of 1 mL/min. A) The elution profile (OD280nm) with the ladder at the bottom of the graph representing the fractions collected during the run. B)Elution profile for standard proteins to calibrate the SEC column where F is ferritin, Ald is aldolase, C is conalbumin, O is ovalbumin (45kDa), CA is carbonic anhydrase (29.2 kDa), R is RNase A, and Apr is aprotinin (Cytvia). C)A 12% acrylamide SDS-PAGE analysis of select fractions from the BLC23O SEC purification. Figure S2. Folin–Ciocalteu assay development. A) Calibration curve for determination of total phenolic content. Folin–Ciocalteu reagent was added to known concentrations of tannic acid ranging from 0 to 30 ug/mL and left to react for 45 min. Absorbances were then measured at 725 nm. The data represent the mean and standard deviation (n=3). A linear fit of the data with an equation of y=0.0127x and a R2 value of 0.9981 are shown. B) Evaluation of Folin–Ciocalteu reagent kinetics. Reaction solutions with volumes of 250 μL were prepared with 0.125 N Folin–Ciocalteu reagent, 0.125 mg/mL sodium carbonate, and 14 μg/mL tannic acid. The absorbance at 725 nm was monitored for 180 min in 15-min intervals. The data represent the mean and standard deviation (n=3). Figure S3. Representative images of commercially available phenolic compounds tested as substrates for BLC23O. Figure S4. Biocatalytic reduction of phenols in purified phenolic compounds using BLC23O. Top row) Phenolic content in samples containing purified compounds as indicated, was evaluated in the presence (black) and absence (blue) of BLC23O over time. An enzyme-only control sample was also assessed (grey). Reactions were initiated with the addition enzyme at 32.5 °C. Samples were taken in 30 min intervals and reacted with the Folin–Ciocalteu reagent. Time zero was set to 100 % phenol and changes in absorbance at 725nm plotted on a percentage change basis. Bottom row) The observed changes in phenol content of BLC23O treated compounds as indicated were quantified relative to untreated fractions. The data represent the mean and standard deviation (n=3). Linear fits of the data and the corresponding equations and coefficients of determination are shown.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,017 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,003 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,882 | 0,199 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».