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Enregistrement W6977615828 · doi:10.6084/m9.figshare.c.7173751

Purine salvage promotes treatment resistance in H3K27M-mutant diffuse midline glioma

2024· other· en· W6977615828 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2024
Typeother
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMilitary Technology and Strategies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPurinePurine metabolismHypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferaseNucleotide salvageDe novo synthesisAdenine phosphoribosyltransferasePurine analogueEnzymeIn vivoMetabolism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Diffuse midline gliomas (DMG), including diffuse intrinsic pontine gliomas (DIPGs), are a fatal form of brain cancer. These tumors often carry a driver mutation on histone H3 converting lysine 27 to methionine (H3K27M). DMG-H3K27M are characterized by altered metabolism and resistance to standard of care radiation (RT) but how the H3K27M mediates the metabolic response to radiation and consequent treatment resistance is uncertain. Methods We performed metabolomics on irradiated and untreated H3K27M isogenic DMG cell lines and observed an H3K27M-specific enrichment for purine synthesis pathways. We profiled the expression of purine synthesis enzymes in publicly available patient data and our models, quantified purine synthesis using stable isotope tracing, and characterized the in vitro and in vivo response to de novo and salvage purine synthesis inhibition in combination with RT. Results DMG-H3K27M cells activate purine metabolism in an H3K27M-specific fashion. In the absence of genotoxic treatment, H3K27M-expressing cells have higher relative activity of de novo synthesis and apparent lower activity of purine salvage demonstrated via stable isotope tracing of key metabolites in purine synthesis and by lower expression of hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase (HGPRT), the rate-limiting enzyme of purine salvage into IMP and GMP. Inhibition of de novo guanylate synthesis radiosensitized DMG-H3K27M cells in vitro and in vivo. Irradiated H3K27M cells upregulated HGPRT expression and hypoxanthine-derived guanylate salvage but maintained high levels of guanine-derived salvage. Exogenous guanine supplementation decreased radiosensitization in cells treated with combination RT and de novo purine synthesis inhibition. Silencing HGPRT combined with RT markedly suppressed DMG-H3K27M tumor growth in vivo. Conclusions Our results indicate that DMG-H3K27M cells rely on highly active purine synthesis, both from the de novo and salvage synthesis pathways. However, highly active salvage of free purine bases into mature guanylates can bypass inhibition of the de novo synthetic pathway. We conclude that inhibiting purine salvage may be a promising strategy to overcome treatment resistance in DMG-H3K27M tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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