Additional file 5 of TRIM25 promotes Capicua degradation independently of ERK in the absence of ATXN1L
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 5: Figure S4 CIC interactors. A) Representative Western blot of CICKO cells with stable FLAG tagged CIC-S reintroduced treated with ATXN1L siRNA over 72 hours. Scrambled siRNA was used as a negative control. B) Immunofluorescence images of proximity ligation assay showing FLAG-tagged CIC-S-14-3-3 interaction in NHA-S cells treated with ATXN1L siRNA. Scrambled siRNA was used as a negative control. White bars denote 10μm. Right: Tukey boxplots showing quantification of number of FLAG-14-3-3 foci/cell. C) Immunofluorescence images of proximity ligation assay showing FLAG-tagged CIC-S-TPR interaction in NHA-S cells treated with ATXN1L siRNA. Scrambled siRNA was used as a negative control. White bars denote 10μm. Right: Tukey boxplots showing quantification of number of FLAG-TPR foci/cell. D) Representative Western blot of CIC immunoprecipitation showing interaction with TRIM25 in ATXN1LWT (HEK) and ATXN1LKO (A30) cell lines. E) Immunofluorescence images showing cellular TRIM25 localization in ATXN1LWT (NHA) and ATXN1LKO (B82) cell lines. * PLA quantifications were collected from 65 individual cells. Error bars represent one standard deviation. p-values were calculated using the two-tailed independent Student’s t-test. Statistically significant values are denoted (* = p < 0.05, ** = p < 0.01, *** = p < 0.001).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,018 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,899 | 0,204 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».