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Enregistrement W6977776979 · doi:10.6084/m9.figshare.c.6735590

Genomic virulence features of Beauveria bassiana as a biocontrol agent for the mountain pine beetle population

2023· other· en· W6977776979 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2023
Typeother
Langueen
DomaineEconomics, Econometrics and Finance
ThématiqueImpulse Buying and Technology Impacts
Établissements canadiensUniversity of AlbertaCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBeauveria bassianaBassianaEntomopathogenic fungusBark beetleMountain pine beetlePopulationInsectBiological pest control

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The mountain pine beetle, Dendroctonus ponderosae, is an irruptive bark beetle that causes extensive mortality to many pine species within the forests of western North America. Driven by climate change and wildfire suppression, a recent mountain pine beetle (MPB) outbreak has spread across more than 18 million hectares, including areas to the east of the Rocky Mountains that comprise populations and species of pines not previously affected. Despite its impacts, there are few tactics available to control MPB populations. Beauveria bassiana is an entomopathogenic fungus used as a biological agent in agriculture and forestry and has potential as a management tactic for the mountain pine beetle population. This work investigates the phenotypic and genomic variation between B. bassiana strains to identify optimal strains against a specific insect. Results Using comparative genome and transcriptome analyses of eight B. bassiana isolates, we have identified the genetic basis of virulence, which includes oosporein production. Genes unique to the more virulent strains included functions in biosynthesis of mycotoxins, membrane transporters, and transcription factors. Significant differential expression of genes related to virulence, transmembrane transport, and stress response was identified between the different strains, as well as up to nine-fold upregulation of genes involved in the biosynthesis of oosporein. Differential correlation analysis revealed transcription factors that may be involved in regulating oosporein production. Conclusion This study provides a foundation for the selection and/or engineering of the most effective strain of B. bassiana for the biological control of mountain pine beetle and other insect pests populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,817
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0290,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle