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Enregistrement W6977936854 · doi:10.6084/m9.figshare.c.3614618_d1.v1

Additional file 1: Table S1. of Host species identity, site and time drive temperate tree phyllosphere bacterial community structure

2016· article· en· W6977936854 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGenetic and Environmental Crop Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTaxonomic rankTemperate rainforestTable (database)Species richnessTaxonPhyllosphereCladeTemperate climate

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Description of the four study sites during the summer of 2013 (Canadian historical climate data, http://climate.weather.gc.ca/ ). Table S2. Taxonomic identity of the 19 core microbiome OTUs across the 142 trees sampled. Taxonomic identification was based on a BLAST against the greengenes database with a minimum cutoff of 50 % confidence required for assignment to a given taxonomic group. Table S3. Significative associations between bacterial taxonomic groups (a-Phylum, b-Class, c-Order, d-Family and e-OTUs) and tree species (LEfSe analyses). Scores identify which clades have the greatest explanatory power on differences between communities. Table S4. Significative associations between bacterial taxonomic groups (a-Phylum, b-Class, c-Order, d-Family and e-OTUs) with tree species classified between angiosperms and gymnosperms (LEfSe analyses). Scores identify which clades have the greatest explanatory power on differences between communities. Table S5. Taxonomic and functional trait information of the five tree species used in this study. Sources for functional trait information are described in the main text. Figure S1. Location of the four sites sampled during summer 2013 across the temperate forest of Quebec’s province. Figure S2. Collector’s curve (mean 95 % confidence interval) of bacterial phyllosphere operational taxonomic units (OTUs; 97 % sequence similarity cut-off) richness versus number of trees sampled in the temperate forest in 2013. (DOC 1640 kb)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,989
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,9900,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,176
Écart entre enseignants0,159 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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