Chronic wasting disease detection in the lymph nodes of free-ranging cervids by real time quaking-induced conversion
Notice bibliographique
Résumé
Chronic wasting disease (CWD), a transmissible spongiform encephalopathy of deer, elk and moose, is the only prion disease affecting free-ranging animals. First identified in northern Colorado and southern Wyoming in 1967, new epidemic foci of the disease have since been identified in additional states, as well as two Canadian provinces and the Republic of South Korea. Identification of CWD-affected animals currently requires post-mortem analysis of brain or lymphoid tissues using immunohistochemistry (IHC) or an enzyme linked immunosorbent assay (ELISA), with no practical way to evaluate potential strain types or investigate the epidemiology of existing or novel foci of disease. Using a standardized real time quaking induced conversion (RT-QuIC) assay, a seeded amplification assay employing recombinant prion protein as a conversion substrate and Thioflavin T (ThT) as an amyloid-binding fluorophore, we blindly analyzed 1243 retropharyngeal lymph node samples from white-tailed 35 deer, mule deer and moose, collected in the field from current or historic CWD-endemic areas. RT-QuIC results were then compared with those obtained by conventional IHC and ELISA, and amplification metrics using ThT and Thioflavin S examined in relation to clinical history of the sampled deer. The results indicate that RT-QuIC is useful in both for identifying CWD-infected animals and facilitating epidemiologic studies in CWD endemic and non-endemic areas.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».