Early Growth Response 2 (Egr2) Induction by Neuronal Activity-dependent Nuclear Factor Kappa B (NF-κB) Activation
Notice bibliographique
Résumé
Nuclear factor kappa B (NF-κB) mediated signalling is complex and plays a critical role in many biological processes. Investigators have reported that NF-κB is activated during the induction of long term potentiation (LTP), a proposed mechanism for memory encoding, and may be a requirement for synaptic plasticity and memory. In this study, mRNA extracted from hippocampal slices of NF-kB p50 knockout mice and its littermate before and after induction of LTP was analyzed using DNA microarray analysis (Affy-metrix GeneChip® Mouse Genome 430 2.0) to explore candidate target genes of NF-kB in LTP. The early growth response 2 (Egr-2) was identified as one putative NF-kB target gene. Egr-2 mRNA and protein analysis of primary cortical neurons and HeLa cells chemically stimulated with Tumor Necrosis Factor α (TNFα) to activate the NF-kB sig-nalling pathway confirmed the microarray results. In addition, examination of the Egr-2 promoter sequence for NF-kB binding sites using chromatin immunoprecipitation (ChIP) and electrophoretic mobility shift assays (EMSA) confirmed promoter occupancy and specificity of binding in vivo, respectively. These data suggest that Egr-2 expression level is controlled by direct transcriptional activity of the NF-kB transcription factor.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».