Ego3, a regulator of TORC1 signaling, is degraded by the \nintralumenal fragment pathway
Notice bibliographique
Résumé
Target of rapamycin complex 1 (TORC1) is a conserved protein kinase complex whose activity controls metabolism in eukaryotic cells. To function, TORC1 and its regulators are localized to lysosome membranes. The mechanism(s) that control TOR complex protein lifetimes remain enigmatic. The IntraLumenal Fragment (ILF) pathway is a selective protein degradation pathway that involves lysosomes. Thus, I hypothesized that components of TORC1, EGO and SEA complexes may be degraded by this ILF pathway. \nUsing the yeast S. cerevisiae and its vacuolar lysosome (or vacuole) as models, I tested this hypothesis by first imaging live cells by fluorescence microscopy. I found that several subunits of TORC1, EGO and SEA complexes tagged with GFP are sorted into boundaries between docked vacuoles and accumulate within the vacuole lumen. However, when I isolated vacuoles from cells and repeated this experiment in vitro, I found that nearly all components re-localized to endosomes. The only exception was Ego3, a subunit that tethers the EGO complex to vacuole membranes. I then applied rapamycin, an inhibitor of TOR, to induce TOR protein downregulation and degradation. In vivo, I found that rapamycin stimulated sorting of TOR complex . Whereas, in vitro, rapamycin only enhanced sorting, internalization and degradation of Ego3. \nIn conclusion, many components of TOR signaling complexes seem to be degraded by the ILF pathway including Ego3. Thus, I speculate that the ILF pathway may play an important role in downregulating TOR activity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».