Genetic variation in Pro-melanin-concentrating hormone affects carcass traits in Bos taurus cattle
Notice bibliographique
Résumé
The purpose of this research was to determine whether genetic variation existed within Bos taurus Pro-melanin-concentrating hormone (PMCH), and whether this variation would affect carcass traits. PMCH had previously been shown to affect appetite and metabolism in rodent species, thus it was desirable to determine whether the gene had a similar effect in cattle, which could be interpreted based on carcass measurements of weight gain and fat production. Cattle PMCH was sequenced and an adenosine-to-thymine (A>T) single nucleotide polymorphism (SNP) was detected 134 bp upstream of the translational start site. The SNP alleles were determined to significantly affect carcass traits including average fat and grade fat in two populations of cattle, and shear force measurements in one population. The adenosine homozygotes were found to have the highest fat levels and the thymine homozygotes the least, while the heterozygous animals had intermediate fat levels. Shear force values in the one available population indicated that cuts of meat from the adenosine homozygotes were most tender, while cuts from the thymine homozygotes were least tender. The SNP was also found to significantly affect tenderness and palatability of meat, as evaluated by a consumer taste panel. The meat from adenosine homozygotes was found to be most tender and palatable. These results could not be validated as this data was unavailable in additional populations. The location of the SNP suggested that it may affect PMCH transcription rates. In silico examination of the different alleles indicated that the thymine allele introduces a novel transcriptional repressor binding site for Adenovirus E4 Promoter Binding protein (E4BP4). Thus, it is believed that the SNP may affect transcriptional levels of the gene by reducing transcription rates in the presence of the thymine allele. Cattle producers are expected to produce cattle with consistent amounts of lean meat and fat. Genetic testing of alleles found to affect fat production and meat tenderness traits are currently available to producers. A DNA test to select breeding stock based on PMCH alleles could be used in conjunction with other tests currently available to further improve carcass quality by selecting for animals with beneficial alleles at numerous genetic loci. Additionally, producers could make use of these findings to genetically sort cattle upon feedlot entry, maximizing the consistency of the finished beef product.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».