Identification of candidate serum biomarkers for schistosomiasis infection using mass spectrometric approaches
Notice bibliographique
Résumé
Schistosome infections, caused by a family of helminth parasites, are major neglected tropical diseases (NTDs) that have serious implications for socio-economic development in many tropical countries. These debilitating and chronic diseases are endemic in more than 70 countries but diagnostic tools are limited and new tests are necessary to limit morbidity and mortality. The development of such tests may be facilitated by the identification of disease-specific biomarkers that are positive early in infection, that can distinguish between acute and chronic infection and that can serve as validation of cure. This thesis work has two major goals: (a) to identify stage-specific proteomic patterns during early (3 week), acute (6 week) and chronic (12 week) Schistosoma mansoni infection in a mouse model; (b) to profile the sera of humans infected by S. mansoni, or S. haematobium and compare these patterns with the protein profile of healthy human serum. To achieve these goals, proteomic analyses were performed on mouse and human sera using several different mass spectrometry (MS) methodologies. These investigations not only identified large numbers of host proteins/protein peaks that are up- or down-regulated in infected sera (mouse and human) but also found large numbers of schistosome-origin proteins in the serum of infected mice. The presence of host proteins, such as transferrin and alpha 1- antitrypsin, as well as one of the schistosome proteins, glutathione S-transferase (GST), were confirmed by Western blot. In addition to these disease- and stage-specific protein profiles, we also identified a number of host proteins that may individually have potential as novel diagnostic tests for schistosome infections in humans, including apolipoprotein A-I (Apo A-I: up-regulated in chronic S. haematobium infected patients) and carbonic anhydrase 1 (CA1: down-regulated in chronic S. mansoni infected patients). If confirmed in larger field studies, these novel biomarkers, and others yet to be identified from our large MS databases, have the potential to contribute significantly to schistosomiasis detection and subsequent eradication efforts. â
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».