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Enregistrement W6983478652

Mechanical changes in the epithelial to mesenchymal transition

2020· dissertation· en· W6983478652 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2020
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAmgen
Mots-clésMesenchymal stem cellTransition (genetics)Epithelial–mesenchymal transitionStrain (injury)
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cell motility is essential in many physiological events such as embryonic morphogenesis and tissue repair.Abnormal cell migration can lead to various pathological events including cancer metastasis.Therefore, understanding physical changes associated with cell migration is important to our understanding of many biological processes.One specific biological transformation with far ranging cell motility impact in physiology and pathology is the Epithelial to Mesenchymal Transition (EMT); in this process, epithelial cells lose cell-cell contacts and become more migratory and invasive mesenchymal cells.While important for diverse biological processes, this transition is believed to be a key phenomenon in cancer metastasis.Therefore, studying physical changes that cells undergo during EMT is critical for understanding the metastatic hallmark of increased cancer cell migration.In this thesis, I studied the changes in contractile forces and work during EMT utilizing a new soft silicone-based Traction Force Microscopy (TFM) assay that I developed to study contractile forces that adherent crawling cells apply on their environment.Using our new polydimethylsiloxane (PDMS) assay, I found there was a significant increase in contractile work and stress.Furthermore, I observed that cells change actin architecture and increase their shear moduli as they transition from epithelial phenotype to mesenchymal phenotype.To better understand how migratory behavior of the cells changes during this transition, I examined motility of individual cells in a monolayer sheet by tracking nuclei of cells, revealing a transition from diffusive to ballistic movement during EMT.Together, these studies help us to have a more comprehensive knowledge of biophysics of EMT and cancer metastasis.This may open the door to new biophysical approaches to diagnosis and therapy for the disease.Beyond EMT, I also

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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