MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W6983525414

Molecular scanning of the human PPAR-alpha gene : Association of the L162V mutation with hyperapobetalipoproteinemia

2000· article· en· W6983525414 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueCorpus Université Laval (Université Laval) · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMissense mutationAlleleMutationExonGeneType 2 diabetesAllele frequencyGenotypeDiabetes mellitusCoding region
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARα) is a member of the steroid hormone receptor super family involved in the control of cellular lipid utilization. This makes PPARα candidate gene for type 2 diabetes and dyslipidemia. The aim of this study was to investigate whether genetic variation in the human PPARα gene can influence the risk of type 2 diabetes and dyslipidemia among French Canadians. We therefore first determined the genomic structure of human PPARα, and then designed intronic primers to sequence the coding region and the exon-intron boundaries of the gene in 12 patients with type 2 diabetes and in 2 nondiabetic subjects. Sequence analysis revealed the presence of a L162V missense mutation in exon 5 of one diabetic patient. Leucine 162 is contained within the DNA binding domain of the human PPARα gene, and is conserved among humans, mice, rats, and guinea pigs. We subsequently screened a sample of 121 patients newly diagnosed with type 2 diabetes and their age and sex-matched nondiabetic controls, recruited from the Saguenay-Lac-St-Jean region of Northeastern Quebec, for the presence of the L162V mutation by a PCR-RFLP based method. There was no difference in L162 homozygote or V162 carrier frequencies between diabetics and nondiabetics. However, whether diabetic or not, carriers of the V162 allele had higher plasma apolipoprotein B levels compared to noncarriers (P 5 0.05). To further this association, we screened another sample of 193 nondiabetic subjects recruited in the greater Quebec City area. Carriers of the V162 allele compared with homozygotes of the L162 allele had significantly higher concentrations of plasma total and LDL-apolipoprotein B as well as LDL cholesterol (P </= 0.02). These results suggest an association between the PPARalpha V162 allele and the atherogenic/hyperapolipoprotein B dyslipidemia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,678

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,174
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCorpus Université Laval (Université Laval)Même sujetPeroxisome Proliferator-Activated ReceptorsTravaux en français237 207