Phosphorylation and binding partners of the human NFE2L3 (NRF3) transcription factor
Notice bibliographique
Résumé
Changes in gene expression underlie nearly all biological processes and are governed by the action of transcription factors. Here, we analyzed the NFE2L3 (Nuclear factor (erythroid-derived 2)-like 3) protein, also known as NRF3, a member of the Cap'n'Collar (CNC) transcription factor family. In order to characterize the phosphorylation status of NFE2L3, we created a GST-tagged NFE2L3 fusion protein, which was used as a substrate in a kinase screen developed by Screaton and colleagues (University of Ottawa). Out of 420 kinases assessed, 5 were found to phosphorylate NFE2L3 including polo-like kinase 1 (PLK1). Phosphorylation of NFE2L3 by PLK1 was further confirmed by in vitro kinase assays. Immunoprecipitation studies suggested NFE2L3 interacts with PLK1.Next, we were interested in determining whether glycogen synthase kinase 3 (GSK3) regulates NFE2L3 turnover. Recently, our laboratory discovered NFE2L3 to be ubiquitinated and dependent on the f-box and WD repeat domain-containing 7 (FBW7) ubiquitin ligase (Kannan et al., in preparation). This suggested that GSK3 may be regulating these events as it has been documented extensively to function in concert with FBW7 by first phosphorylating its substrates thereby facilitating FBW7 binding. Corroborating with these data, we showed that GSK3 can bind and phosphorylate NFE2L3. We also found that NFE2L3 expression was stabilized using an inhibitor of GSK3 as well as upon knockdown of GSK3. Finally, GSK3 knockdown rescued FBW7 driven destabilization of NFE2L3. This showed that FBW7-mediated turnover of NFE2L3 is dependent on GSK3 phosphorylation. The final goal of this project was to identify novel NFE2L3 interacting proteins. In order to do so, immunoprecipitation together with mass spectrometric analysis was utilized. These experiments uncovered a series of potential interactors. Of these, the protein golgin-84 was shown to be a bona fide binding partner of NFE2L3. These data indicated the transcription factor may be targeted to the golgi.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».