Scission of Glucosidic Bonds by a Lentinus similis Lytic Polysaccharide Monooxygenases Is Strictly Dependent on H<sub>2</sub>O<sub>2</sub>while the Oxidation of Saccharide Products Depends on O<sub>2</sub>
Notice bibliographique
Résumé
Lytic polysaccharide monooxygenases (LPMOs) are mononuclear copper enzymes that act in synergy with glycoside hydrolases to saccharify the most abundant polysaccharides in nature. Both O 2 and H 2 O 2 can be cosubstrates for LPMOs. The Lentinus similis LPMO (LsAA9A) has previously been shown to oxidatively cleave oligosaccharides when supplied with ascorbate as a reductant. This study demonstrates that LsAA9A is unable to complete the catalytic cycle and cleave cellulose without H 2 O 2 . Instead, cellooligomers efficiently prevent the slow continuous oxidation of ascorbate taking place under ambient conditions in the absence of a substrate. LsAA9A specifically cleaves cellooligomers in a fast and stoichiometric reaction with H 2 O 2 as a cosubstrate. However, the product profile contains more non-oxidized saccharides than anticipated by the generally accepted LPMO reaction scheme. The scission of glucosidic bonds and oxidation of the saccharide therefore appear not to be directly coupled. This was confirmed by the complete absence of oxidized products under anoxic conditions. A mechanism is proposed involving the hydrolysis of a cellulosic radical formed by a H 2 O 2 -derived caged hydroxyl radical. In addition, LsAA9A catalyzes another stoichiometric reaction with excess H 2 O 2 to oxidize ascorbate in the absence of cellulose. Ascorbate is not a cosubstrate for the reaction leading to the scission of glucosidic bonds by LsAA9A.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».