Siderophore transport through Escherichia coli outer membrane receptor FhuA
Notice bibliographique
Résumé
Hydroxamate siderophore receptor FhuA is a TonB-dependent outer membrane protein of Escherichia coli composed of a C-terminal 22-stranded beta-barrel occluded by an N-terminal globular cork domain. During transport of siderophores into the periplasm, FhuA is proposed to undergo conformational changes that may form a pathway across the barrel. To probe structural changes, site-directed cysteine mutants of selected amino acids in the cork domain (L109C and Q112C) and in the barrel domain (S356C and M383C) were created within the putative siderophore transport pathway. Molecular modeling predicted that double-cysteine mutants FhuACys109,356 and FhuACys112,383 would form disulfide bonds, thereby tethering the cork and barrel domains. Double-cysteine FhuA mutants denatured under non-reducing conditions were labelled with thiol-specific Oregon Green maleimide and subjected to SDS-PAGE analysis. Two distinct species were observed: FhuA containing a disulfide bond and FhuA with free sulfhydryl groups. To address the role of the putative siderophore transport pathway and to evaluate possible rearrangements of the cork domain during ferricrocin transport, an oxidation catalyst was used to enhance disulfide bond formation. After disulfide tethering of cork to barrel, ferricrocin transport was equivalent to transport by untreated cells. Furthermore, cells containing double-cysteine FhuA mutants that were subjected to oxidation during ferricrocin transport exhibited disulfide bond formation to near completion. These results demonstrate that blocking the putative siderophore transport pathway did not abrogate siderophore uptake. We propose that during ferricrocin transport through FhuA, the cork domain remains within the barrel rather than its being displaced.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».