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Enregistrement W6987430339

Surface expression regulation of potassium voltage-gated channels

2024· dissertation· fr· W6987430339 sur OpenAlexafffund

Notice bibliographique

RevuePapyrus : Institutional Repository (Université de Montréal) · 2024
Typedissertation
Languefr
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésInward-rectifier potassium ion channelPotassiumKDEL
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Les canaux ioniques permettent le passage des ions continuel ou en réponse à des stimuli, jouant un rôle important dans le fonctionnement cellulaire. Les mutations génétiques dans les canaux ioniques peuvent causer plusieurs troubles neurodéveloppementaux et cardiovasculaires, collectivement appelés canalopathies. Bien que les altérations génétiques des canaux ioniques modifient l’expression des canaux, les mécanismes cellulaires régulant l'expression des canaux à la surface restent inconnus. Pour répondre à cette question, nous avons étudié l'expression en surface des variantes zH4IR et W434F du canal potassique régulé par le voltage (Kv) Shaker. La variante W434F s'exprime près de 300 fois plus que zH4IR. La coexpression des deux variantes indique la formation d'un complexe hétéromérique entre les deux variantes. Pour vérifier si les propriétés non conductrices de la variante W434F modulent positivement son trafic du réticulum endoplasmique (ER) vers la surface, nous avons introduit un courant de K+ dans la membrane plasmique ou l'ER en utilisant soit des variantes zH4IR, soit KDEL d'un canal potassique rectifiant inward Kir7.1, la séquence KDEL entraînant la rétention de Kir7.1 dans l'ER. La coexpression avec Kir7.1-KDEL, et non avec Kir7.1, a diminué le nombre de canaux W434F à la surface, tandis que l'expression de zH4IR est restée inchangée. L'expression des variantes de canaux en présence de 4-Aminopyridine (4-AP), un bloqueur de Kv perméable, a augmenté le nombre de canaux zH4IR, mais pas ceux de W434F. Cela suggère que la conductance de K+ à travers l'ER lors de l'assemblage des canaux régule le nombre de canaux Kv à la surface de la cellule.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,185
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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