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Enregistrement W6987506201

The Synthesis and kinetic evaluation of lysosomotropic substrate-based probes for cathepsins B and L

2015· dissertation· en· W6987506201 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueKnowledge Commons (Lakehead University) · 2015
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésFusible alloyCathepsinIn vivoLysosomal storage disease
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Members of the cathepsin family of cysteine proteases are gaining interest as potential imaging biomarkers and drug targets due to their multifunctional roles in a range of diseases such as cancer, asthma and arthritis. Cathepsins are also involved in important regulatory processes such as cell recycling, prohormone activation, and wound healing. Developing imaging agents with the ability to assess cathepsin activity in vivo is important for identifying the specific roles these enzymes have in disease processes. We report here novel prodrug-inspired probes for Cathepsins B and L that employ weakly basic aminoquinoline reporter groups intended to be lysosomotropic once released from the enzyme, meaning they are expected to be retained in the acidic lysosome where the majority of cysteine cathepsins are primarily active. To evaluate this approach to probe design we first synthesized a series of prodrug inspired substrates using the self-immolative linker p-aminobenzyl alcohol conjugated to four different aminoquinolines as potential reporters of enzyme activity. We then developed a convenient HPLC method to estimate kcat/KM values for well-established fluorogenic substrates to first validate our new HPLC method. Once a reliable HPLC method was developed for fluorogenic substrates consistent with data obtained on a plate reader, we then determined kcat/KM values for all novel quinoline-based probe candidates. All compounds were excellent substrates of both CTB and CTL, and three candidates were hydrolyzed with particularly efficient kcat/KM values by CTL. This suggests that efficiently hydrolyzed prodrug-inspired probes bearing aminoquinoline reporters could potentially be adapted into substrate-based PET imaging agents which offer an amplification of signal and reporter immobilization in the lysosomes of cancer cells overexpressing CTL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,144
Score d'incertitude au seuil0,991

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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