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Enregistrement W6987616786

Towards personalised medicine for STAT1 gain-of-function primary immunodeficiency

2023· dissertation· en· W6987616786 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueUCL Discovery (University College London) · 2023
Typedissertation
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésDiseaseContext (archaeology)Filter (signal processing)Noise (video)Limiting
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Germline, monoallelic, gain-of-function (GOF) mutations in signal transducer and activator of transcription 1 (STAT1) cause an ultra-rare form of primary immunodeficiency (PID) through overactivation of the Janus-associated kinase/STAT1 signalling pathway. The clinical phenotype of this disorder is extremely variable and encompasses chronic mucocutaneous candidiasis, combined immunodeficiency and autoimmunity. To date, the functional validation of STAT1 GOF PID remains a significant challenge due to inconsistent access to specialised testing. Genotype: phenotype correlations have also remained elusive, and the molecular mechanism driving the disease is yet to be described. This, in part, means that the clinical management of STAT1 GOF PID at present is mainly limited to supportive care with antimicrobial prophylaxis and prompt treatment of infections. 
\n
\nIn this study, a standardised, flow cytometric-based diagnostic assay panel was designed and optimised to facilitate an accurate yet simple, functional diagnosis of STAT1 GOF PID. Secondly, the collation of clinical data from 428 patients with STAT1 GOF mutations worldwide identified that distinct mutations manifest in unique clinical phenotypes, particularly the T385M GOF mutation which induces a significantly greater disease course severity in comparison to all other mutations. Furthermore, through the development of cell line models and the interrogation of patient primary cells, four distinct molecular mechanisms potentially underpinning STAT1 GOF disease that depend upon the dimeric interface the mutation resides at were outlined. Finally, the design, development, and assessment of three gene editing approaches for STAT1 GOF PID is described. 
\n
\nThis work has opened more avenues for disease interrogation and targeting, has provided proof-of-concept for gene editing as a potentially curative measure for patients with STAT1 GOF PID and could potentially impact clinical decision making and prognostication. But ultimately, it supports the notion of a more personalised approach to treating STAT1 GOF PID.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,606
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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