Uncovering novel genetic variation in Aegilops tauschii the wheat D genome progenitor
Notice bibliographique
Résumé
Wheat is one of the world’s most important staple crops, accounting for roughly 20% of all calories consumed globally. However, wheat production faces multiple significant challenges that may limit yields, especially in the face of a changing climate. One of these major challenges is the threat posed by different pests and pathogens. To combat these threats and safeguard wheat yields, identifying novel sources of disease resistance represents an important objective in wheat breeding. Wheat wild relatives, such as Aegilops tauschii, the wheat D genome progenitor, contain valuable genetic diversity that can be harnessed to achieve this goal. In this study, a diversity panel of Ae. tauschii accessions collected from across the species endemic range was assessed for resistance against two important diseases of wheat: stripe rust and eyespot. This enabled a k-mer based association mapping approach to rapidly identify novel genetic associations linked to resistance against both diseases. In collaboration with researchers in North America, and a European wheat breeder, RAGT Seeds Ltd, multiple unique isolates of Puccinia striiformis f. sp. tritici (PST) the causative agent of stripe rust, were phenotyped against the two major lineages of Ae. tauschii. This led to the discovery of several new alleles of a major broad-spectrum R gene, Yr28, in addition to the identification of two isolate specific R genes on chromosomes 5DL and 2DS, that convey protection against a Canadian race, and a UK race of PST respectively. Furthermore, employing the same methodology to cereal eyespot, a disease with sparsely documented resistance available, led to the discovery of the first major R gene for this disease in many years. This gene, designated Pch4, provides potent resistance comparable to that of the most commonly deployed R gene Pch1, and was demonstrated here to convey resistance in both Ae. tauschii and hexaploidy wheat. The research contained within this study represents a significant step forward in our understanding of the novel genetic resistance available in Ae. tauschii for both diseases and will aid in future research to uncover further genetic loci relevant for wheat breeding.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».