MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W6989442083

Assessing differential expression of genes associated with nickel resistance in jack pine (Pinus banksiana) and eastern white pine (Pinus strobus): effects of nickel toxicity

2021· dissertation· en· W6989442083 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueLu Zone Ul (Laurentian University) · 2021
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Stress Responses and Tolerance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDownregulation and upregulationMetal toxicityNitrate reductaseToxicityHormesisGeneGene expressionNickelPeroxidase
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Eastern white pine (Pinus strobus) and jack pine (P. banksiana) represent two of the
\nmajor coniferous species planted in the metal contaminated region of Northern Ontario. Studies
\non coping mechanisms of these two species to soil metal contamination are limited. The main
\nobjectives of the present project were to 1) determine how these two species respond to soil
\nnickel (Ni) contamination and 2) assess the effects of different doses of nickel on the expression
\nof six genes associated with Ni resistance. These genes include high affinity Ni transporter
\nfamily (AT2G16800), 1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid deaminase (ACC deaminase),
\nNatural resistance-associated macrophage proteins (NRAMP3), and serine acetyltransferase
\n(SAT), Nicotianamine synthase (NAS) and Glutathione reductase (GR). Seedlings were grown in
\nsoils treated with increasing concentrations of Ni(NO3)2. Potassium nitrate (KNO3) was used to
\ncontrol for potential toxicity of nitrate ions. Gene expression was assessed using RT-qPCR.
\nDamage ratings reveal that P. banksiana is sensitive to Ni(NO3)2 doses of 1,600 and 3,200 mg/kg
\nas well as 3,200 mg/kg KNO3. However, P. strobus was tolerant to all treatment. Soil Ni
\ntreatments induced a downregulation of NAS in P. strobus as well as AT2G16800 and NRAMP3
\nin both species with the severity increasing at high doses of Ni. An upregulation of ACC in both
\nspecies consistent with an inverted-U hormetic effect was observed. Ni also triggered a hormetic
\nU-effect downregulation of SAT in P. strobus with the lowest dose showing the highest
\nrepression. An opposite trend was observed in P. banksiana where Ni induced an upregulation of
\nSAT. Moreover, GR induced an inverted-U hormetic upregulation in P. banksiana. Knowing the
\ncoping mechanisms of these conifers to metal contamination is essential for ensuring their longterm sustainability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,849
Score d'incertitude au seuil0,940

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueLu Zone Ul (Laurentian University)Même sujetPlant Stress Responses and ToleranceTravaux en français237 207