Assessing differential expression of genes associated with nickel resistance in jack pine (Pinus banksiana) and eastern white pine (Pinus strobus): effects of nickel toxicity
Notice bibliographique
Résumé
Eastern white pine (Pinus strobus) and jack pine (P. banksiana) represent two of the \nmajor coniferous species planted in the metal contaminated region of Northern Ontario. Studies \non coping mechanisms of these two species to soil metal contamination are limited. The main \nobjectives of the present project were to 1) determine how these two species respond to soil \nnickel (Ni) contamination and 2) assess the effects of different doses of nickel on the expression \nof six genes associated with Ni resistance. These genes include high affinity Ni transporter \nfamily (AT2G16800), 1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid deaminase (ACC deaminase), \nNatural resistance-associated macrophage proteins (NRAMP3), and serine acetyltransferase \n(SAT), Nicotianamine synthase (NAS) and Glutathione reductase (GR). Seedlings were grown in \nsoils treated with increasing concentrations of Ni(NO3)2. Potassium nitrate (KNO3) was used to \ncontrol for potential toxicity of nitrate ions. Gene expression was assessed using RT-qPCR. \nDamage ratings reveal that P. banksiana is sensitive to Ni(NO3)2 doses of 1,600 and 3,200 mg/kg \nas well as 3,200 mg/kg KNO3. However, P. strobus was tolerant to all treatment. Soil Ni \ntreatments induced a downregulation of NAS in P. strobus as well as AT2G16800 and NRAMP3 \nin both species with the severity increasing at high doses of Ni. An upregulation of ACC in both \nspecies consistent with an inverted-U hormetic effect was observed. Ni also triggered a hormetic \nU-effect downregulation of SAT in P. strobus with the lowest dose showing the highest \nrepression. An opposite trend was observed in P. banksiana where Ni induced an upregulation of \nSAT. Moreover, GR induced an inverted-U hormetic upregulation in P. banksiana. Knowing the \ncoping mechanisms of these conifers to metal contamination is essential for ensuring their longterm sustainability.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».