Defining domains within the Afadin scaffold protein that promote breast and colorectal cancer metastasis
Notice bibliographique
Résumé
One of the most lethal aspects of cancer, estimated to account for 90% of all cancer-related deaths, is the emergence of metastatic disease.Metastasis is the process through which cancer cells leave the primary tumor and colonize distal sites in the body.A prominent site of metastasis common to breast and colorectal cancer is the liver.Previous work has identified Afadin (AF6) as a multi-domain scaffolding protein that plays an integral role in development of lung and liver metastases in breast cancer, a novel finding contrasting with previous studies that suggest Afadin acts as a tumor suppressor.Elevated Afadin expression in primary breast tumors has been correlated with reduced breast cancer specific survival, overall survival and lung metastasis-free survival.Afadin exists as either a short (sAF6) or a long (lAF6) isoform, sharing a common domain structure including: two RAS-association (RA) domains, a forkhead-associated (FHA) domain, a dilute domain (DIL), a PDZ domain and two proline rich regions (PRR).The long isoform has an additional proline rich region in its carboxy-terminus, called the F-actin binding (FAB) domain.Given that these domains allow Afadin to link cell junction components and regulate intracellular signaling networks, we hypothesize that, in the context of triple negative breast cancer, Afadin acquires a pro-metastatic function outside of its role as a junctional protein.Indeed, previous results from our laboratory indicate that in breast cancer cells stable knockout of Afadin has minimal effect on primary tumor growth of but impairs spontaneous metastasis to the lungs and liver, while potentially promoting anchorage independent growth of colorectal cancer cells through interaction with Claudin-2.Building off this work, we are interested in defining the functional domains that contribute to the pro-metastatic functions of AF6.lab, Dr. Siegel's infectious enthusiasm for scientific research reminded me why I was drawn to this discipline in the first place.His insights, patient guidance, and unwavering support have helped shape this project into what it is today.His encouragement and confidence
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».