Defining QUAKING's ribonucleoprotein complex and its potential involvement in microRNA processing
Notice bibliographique
Résumé
The quaking gene encodes a family of alternatively spliced RNA binding protein isoforms that differ in their C-terminal regions. All of the QUAKING (QKI) proteins contain a single stranded RNA binding domain, KH domain, and are part of the larger STAR (Signal Transduction and Activator of RNA) family. These isoforms have expression patterns that differ spatially and temporally and coincide with development of both central and peripheral nervous systems. The QKI proteins have been implicated in several post-transcriptional mechanisms such as pre-mRNA splicing, mRNA export, mRNA stability and protein translation. Although the QKI protein is known to exist as homo- and heterodimeric forms, the size of its cellular complex and its components are largely uncharacterized. Herein, I have confirmed that QKI indeed forms a large protein complex and in addition defined the size of the complex and identified some of its components. Using a second approach, I also identified the microRNA-processing enzyme Argonaute 2 (Ago2) protein as one of QKI interacting proteins and biochemically validated and characterized its association with QKI in vivo. Furthermore, I generated a qkI-6 and qkI-7 conditional allele that will generate a new mouse model, in order to delineate the correlation between QKI and micro RNA processing.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».