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Enregistrement W6991321815

Genetic characterization of clk genes

2006· dissertation· en· W6991321815 sur OpenAlexaffabout

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2006
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCoenzyme Q10 studies and effects
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institutes of Health
Mots-clésGermlineMutantGenePhenotypeCaenorhabditis elegansSuppressor
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

L'auteur a accord une licence non exclusive permettant la Bibliothque et Archives Canada de reproduire, publier, archiver, sauvegarder, conserver, transmettre au public par tlcommunication ou par l'Internet, prter, distribuer et vendre des thses partout dans le monde, des fins commerciales ou autres, sur support microforme, papier, lectronique et/ou autres formats.L'auteur conserve la proprit du droit d'auteur et des droits moraux qui protge cette thse.Ni la thse ni des extraits substantiels de celle-ci ne doivent tre imprims ou autrement reproduits sans son autorisation.Conformment la loi canadienne sur la protection de la vie prive, quelques formulaires secondaires ont t enlevs de cette thse.Bien que ces formulaires aient inclus dans la pagination, il n'y aura aucun contenu manquant. I~' Summaryclk-1 encodes an enzyme involved in the biosynthesis of ubiquinone (UQ), a redox active lipid that is found in all cellular membranes, inc1uding in the mitochondrial respiratory chain.In the nematode Caenorhabditis elegans clk-1 mutants display slow and deregulated physiological rates, inc1uding slow embryonic and post-embryonic development, retarded germline development, slow behaviours, and an increased lifespan.clk-1 slow germline development phenotype was previously linked to clk-1 altered ROS metabolism and its effect on lipid oxidization and the let-60/ras pathway. 1 have taken a genetic suppressor approach to further investigate the causes of the slow germline development phenotype of the clk-1 mutants.Through this approach one mutant that suppresses the germline phenotype of clk-1 was identified.This suppressor, gsc-1(qm216), restored clk-1 germline development to slightly faster rates than wild type worms.This effect was specific to clk-1 and gsc-1 did not speed germline development rates in wild type worms.Furthermore, this effect appeared to be additive to lowering cholesterollevels but not to increasing cytoplasmic ROS levels.gsc-1 by itself appeared to have a deleterious effect on brood size and to increase lifespan.Neither of these effects were additive to the clk-1 phenotype and were therefore believed to affect similar mechanisms.The genetic mapping of gsc-1 precisely located the mutation to the center of chromosome II and linked it tightly to the lin-5 mutation.However, none of the transgenic lines managed to complement the gsc-1 mutation and its identity was not discovered.ln addition, to determine the role of reactive oxygen species (ROS) in the Clk phenotype, 1 have been analyzing all clk mutants (clk-1 to -10), by increasing ROS levels through the disruption of sod-l and sod-2 genes, and scoring Clk phenotypes. 1 found that, although several clk mutants appear to have altered ROS levels, the phenomenon does not apply to aU clk worms and does not correlate with lifespan.The disruption of either sod-1 or -2 affects growth and embryonic viability: sod-2 tends to exacerbate the mutant phenotypes, while sod-1 shows First, 1 would like to thank my supervisor, Dr. Siegfried Hekimi, for his valuable guidance and instruction, and for giving me a chance to work with worms. 1 owe special thanks to Dr.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,111
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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