A genetic analysis of the French Canadian population in search of evidence in favour of novel breast cancer susceptibility genes
Notice bibliographique
Résumé
Germline mutations in the genes, BRCA1 and BRCA2 have been implicated in hereditary breast cancer (HBC) and hereditary breast and ovarian cancers (HBOC). A large-scale multi-center genetic linkage analysis revealed that while linkage to BRCA1 and BRCA2 was evident in the majority of HBOC families, the large proportion of HBC families remained unaccounted for by either of these genes. These findings supported the hypothesis that other novel breast cancer susceptibility genes could account for the unexplained clustering of female breast cancer cases in the HBC families. Previous studies have identified common BRCA1 and BRCA2 mutations in the French Canadian (FC) population. The objective of this thesis was to establish the contribution of BRCA1 and BRCA2 mutations to the HBC and HBOC families in the FC population of Quebec. Mutations were identified in 96 of 224 (43%) families that met our inclusion criteria of at least three verified cases of breast cancer diagnosed below 65 years of age or ovarian cancer. An additional 13 novel mutations were added to the FC mutation spectrum including the BRCA2:3398delAAAAG mutation which was identified in eight independent families. Haplotype sharing of closely related alleles in the carriers of this novel BRCA2 mutation suggested that the mutation was introduced by a common ancestor. Although the FC population was more heterogeneous than originally expected five common mutations accounted for 84% of the mutation carrier families. The BRCA1/BRCA2 phenotype was further defined to include metachronous bilateral breast cancer. In addition, 38 mutation-negative families were identified that were phenotypically indiscernible from the BRCA
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».