Genetic and phenotypic population structure of invasive sea lamprey, Petromyzon marinus, in the Laurentian Great Lakes and Finger Lakes
Notice bibliographique
Résumé
Sea lamprey, Petromyzon marinus, are an invasive species in the Laurentian Great Lakes and Finger Lakes. The parasitic feeding stage is particularly damaging to the lakes’ ecosystem as sea lamprey wound and kill environmentally and economically important fish such as lake trout, Salvelinus namaycush. Since the sea lamprey invasion in the late 1800s significant resources are directed towards the control of sea lamprey using tools such as chemical treatment of larvae and trapping of the spawning adults. Understanding population structure is essential for framing a more effective sea lamprey control program. Studies using microsatellite loci have found genetic differentiation between sea lamprey from the upper and lower Great Lakes, and body size variation has been documented across the lakes, but fine-scale genetic population structure has not been studied. We use whole genome resequencing of 9-20 individuals from each of 15 sites (238 individuals) across the Great Lakes and Finger Lakes (Cayuga and Seneca), and body measurements of 9-36 individuals from each site (472 individuals), to identify population structure among and within the lakes. Genomic analyses showed structure between Lake Ontario, the Finger Lakes, and the other Great Lakes, and body size partially differentiated the lakes. Using high-resolution data to delineate spatial population structure will be important for sea lamprey control because management is most efficiently targeted when the geography of demographically independent populations is well-characterized.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».