MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W6991352630

Genotype and Phenotype Characterisation of an Enhanced Friedreich Ataxia GAA Repeat Expansion Mouse Model Fxn_null::YG8s(GAA)>800

2019· article· en· W6991352630 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueBrunel University Research Archive (BURA) (Brunel University London) · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCollege of Medicine, University of FloridaInstituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar, Universidade do PortoInstituto De Saúde Pública, Universidade do PortoUniversidade do MinhoTaipei Medical UniversityNational Yang-Ming UniversityEberhard Karls Universität TübingenRigshospitaletNational Institutes of HealthEuropean CommissionUniversidade Federal do Rio Grande do SulUniversité de Recherche Paris Sciences et LettresZhejiang UniversityInternational Business Machines CorporationTel Aviv UniversityHokkaido UniversityBundesministerium für Bildung und ForschungAtaxia UKTaipei Veterans General HospitalMinisterio de Ciencia, Innovación y UniversidadesTunghai UniversityMcGill UniversityUniversitat Autònoma de BarcelonaUniversidade do PortoBrain Research Center, National Yang-Ming UniversityGeorgetown UniversityFriedreich's Ataxia Research Alliance
Mots-clésFrataxinTrinucleotide repeat expansionGenetically modified mouseTransgeneAtaxiaExonRatónLoss of heterozygosityKnockout mouse
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Our lab has previously generated YG8R and YG22R FRDA mouse models that are based upon human FXNYAC transgenic mice containing a large FXNhuman genomic transgene with GAA repeat expansions crossed with Fxn- knockout mice. These mouse models have exhibited a rather mild, late-onset FRDA-like phenotype. Therefore, over the last few years we have performed selective breeding of these mice to produce larger GAA repeat expansion containing FRDA mouse models with a more representative earlier onset FRDA-like phenotype. We now have YG8- derived FRDA mice lines with GAA repeat expansion sizes of approximately ~300 repeats (YG8sR), ~400bp repeats (YG8LR) and ~600bp repeats (YG8XLR). More recently, we have obtained the latest FRDA humanised model that was derived from our previous YG8sR mice by Jackson laboratory (Fxnnull::YG8s(GAA)>800). These mice contain a larger expansion of 800 GAA repeats, designated YG8JR. The YG8JR mice underwent a partially different genetic manipulation in which the Fxn-knockout in these models was generated by CRISPR/Cas9 and Cre loxP-mediated deletion of exon 2. These models have the largest GAA repeat sizes of all the current FRDA mouse models. Phe- notypically, these mice exhibit a degree of hair loss and have reduced weight compared with Y47JR control mice. In addition, these mice have shown further decreases in frataxin expression levels compared to all our previous FRDA mouse models. We have also detected increased somatic GAA repeat instability in the brain and cerebellum of YG8JR mice, together with reduced aconitase activity and altered FXN histone modifications and DNA methylation, compared with the control Y47JR mice. Coordination ability of YG8JR mice, together with Y47JR control mice, was assessed using accelerating rotarod analysis. The results indicated a decline in the motor coordination of YG8JR mice at the older age (6-9m) compared to Y47JR controls. We aim to further characterise these mouse models for neurobehavioral deficits and other biochemical and molecular analysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,086
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBrunel University Research Archive (BURA) (Brunel University London)Même sujetGenetic Neurodegenerative DiseasesTravaux en français237 207