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Enregistrement W6991399681

Gene regulation in Drosophila melanogaster in response to an acute dose of ethanol

2010· dissertation· en· W6991399681 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueSussex Research Online (University of Sussex) · 2010
Typedissertation
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsNational Tsing Hua UniversityUniversity of Cambridge
Mots-clésDrosophila melanogasterDNA microarrayMicroarray analysis techniquesGeneMicroarrayIn silicoGene expression profilingGene expressionRegulation of gene expression
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alcohol intake causes gene expression changes resulting in cellular and molecular adaptations that could be associated with a predisposition to alcohol dependence. Expression profiling using high-throughput microarrays has recently been used to identify changes in gene expression that may be associated with alcohol dependence. To clarify the mechanisms and biology underlying alcohol dependence, bioinformatics, behavioural and genetics methodologies were employed to analyse obtained raw microarray data set that was previously generated from Drosophila exposed to an acute dose of ethanol. Classical linear statistical modeling coupled with clustering and functional enrichment analyses were implemented to evaluate whole-head time series microarray data from ethanol-treated and control samples, and implicated many genes or pathways affected by acute ethanol treatment in Drosophila head including those involved in stress signaling, inter and intra cellular signaling, ubiquitinmediated signaling, metabolic switches, and possible transcriptional regulatory components. Further analysis identified interaction networks and patterns of transcriptional regulation within the set of identified genes. Seven of these genes, ana, Axin, hiw, hop, hsp26, hsp83, and mbf1, were verified and linked with novel roles in ethanol behavioural responses using functional tests. Additional work on two of these genes namely, hiw and hsp26 also revealed a role for glia, mushroom bodies and ellipsoid body neurons as important regulators of acute ethanol response in Drosophila. Finally, these studies have demonstrated that microarray analysis is an efficient method for identifying candidate genes and pathways that may be fundamental to human alcohol dependence or abuse.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,395
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,376
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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