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Enregistrement W6991588641

Identification of the downstream target of misshapen in regulating photoreceptor growth-cone targeting in Drosophila

2004· dissertation· en· W6991588641 sur OpenAlexfundaboutno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2004
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDevelopmental Biology and Gene Regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésIdentification (biology)Downstream (manufacturing)Drosophila (subgenus)Expression (computer science)
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neuronal growth cones guide the growing axons toward their target to establish precise neuronal connections during embryogenesis. The growth cone expresses cell surface receptors for recognizing guidance and targeting signals. It also possesses the intracellular signal transduction machinery to convert the extracellular signals into the reorganization of cytoskeletal structures in controlling growth-cone movement. Previous studies identified the SH2/SH3 adapter protein Dock as a key component of an evolutionarily conserved signaling pathway that transduces signals from cell-surface receptors to the growth-cone cytoskeleton to regulate growth cone motility. My M.Sc. studies (Ruan et al., 1999) demonstrated that the Ste20-like Serine/Threonine kinase Misshapen (Msn) functions downstream of Dock to regulate the proper targeting of a subset of R cell (R1-6) growth cones in the developing Drosophila visual system. To identify downstream targets of Msn, I have undertaken a genetic approach to search for second-site mutations that suppress a growth cone premature termination phenotype induced by Msn overexpression. We found that reducing the dosage of bifocal (bif), a gene encoding a putative cytoskeletal regulator, substantially suppressed the msn overexpression phenotype. Phenotypic analysis of bif mutants demonstrates that like loss of msn, loss of bif also specifically caused a failure of R1-6 growth cones to stop at lamina. Eye-specific expression of bif in bif mutants substantially rescued R1-6 targeting defect, indicating that bif is required in R1-6 growth cones for targeting decisions. Like overexpression of Msn, overexpression of Bif also caused pre-target growth cone termination. Biochemical studies show that Msn associated directly with Bif and phosphorylated Bif in vitro. Expression of Bif in cultured cells dramatically increased F-actin level and induced filopodium formation. Bif-induced cytoskeletal changes could be modulated subst

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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