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Enregistrement W6991768895

Identification of molecular changes during compaction in the preimplantation mouse embryo

2019· dissertation· en· W6991768895 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2019
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill Genome Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEmbryoBlastocystEffectorActinCompactionPseudopodia
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Compaction is the first morphogenetic event essential for the formation of the blastocyst during mouse preimplantation development.It is recognized as an increase in cell-cell contact and minimizing the exposed surface area of the embryo.However, the molecular mechanisms governing compaction have not been elucidated.To identify molecular changes before and after compaction, we investigated the distribution of the actomyosin network and the E-cadherin complex, which are major regulators of cell shape.We observed a reduction of both F-actin and phospho-Myosin Light Chain II (pMLCII) at cell-cell contacts, compared to the contact-free surface after compaction, suggesting the generation of two cortical subdomains with distinct biophysical properties within a cell.E-cadherin and β-catenin were evenly distributed across the cell-cell contact and non-contact surfaces before and after compaction.However, we found an increase of α-catenin and a decrease of p120-catenin at cell-cell contacts compared to the contact-free surface after compaction.This suggests that the stoichiometry of the members of the E-cadherin complex appears to be dynamically changing.Homodimer forms of α-catenin have been shown to suppress actin polymerization by blocking ARP2/3 activity at cell-cell contacts and p120-catenin also functions in recruiting ROCK1, a Rho effector which can regulate actomyosin contractility.We speculate that the change in distribution of α-catenin and p120 catenin would contribute to the reduction of F-actin and pMLCII at cell-cell contacts during compaction.In E-cadherin null embryos, the actomyosin network at cell-cell contacts was not lowered at the 8-cell stage.As expected, cortical localization of p120-catenin and β-catenin, both at cell-cell contacts and contact-free surface, was E-cadherin dependent.Interestingly, while α-catenin localization at the non-contact surface is E-cadherin dependent like other catenins, its localization at cell-cell contacts is E-cadherin independent.These results suggest that E-cadherin regulates the actomyosin network through canonical and non-canonical means at cell-cell contacts and the non-contact surface, respectively.4 Résumé Pendant le développement du l'embryon de la souris, le compactage est le premier évènement essential pour the génération du blastocyste.Nous reconnaissons le compactage par le grandissent du contact entre les cellules et la diminution du surface du l'embryon.Toutefois, on ne connaît pas le mécanisme moléculaire qui gouverne le compactage du l'embryon.Pour identifier les changements moléculaires avant et après le compactage, nous avons examiné la distribution des molécules de la groupe actomyosine et le complexe de E-cadherin-catenin, qui sont importante pour régler la forme des cellules.Nous avons observé une réduction de F-actin et le phospho-Myosin Light Chain II au contact des cellules après le compactage.Ses résultats proposent que la production de deux différents domaines corticaux dans un cellule est nécessaire pour le compactage.Nous avons aussi observé que E-cadherin et β-catenin sont également distribué autour tout le cortex, avant et après le compactage.Toutefois, nous avons aussi observé une augmentation de α-catenin et une diminution de p120-catenin au contact des cellules après le compactage.Ça nous dit que la complexe de E-cadherin-catenin change avant and après le compactage.Le forme homodimère de α-catenin étouffe l'activité de ARP2/3, qui fonctionne à la polymérisation de F-actin.P120-catenin est aussi trouver de recruté ROCK1, une molécule qui control la fonction de phospho-Myosin Light Chain II.Nous proposons une théorie que la distribution de α-catenin et p120-catenin sont responsables pour la réduction de F-actin et phospho-Myosin Light Chain II au contact entre les cellules.Les embryons mutants qui manquent du E-cadherin, (MZ)Cdh1 -/-, ne peuvent pas réduire le F-actin et phospho-Myosin Light Chain II a l'étape de 8-cellules.On a aussi observé que la localisation de β-catenin et p120catenin sont dépendons à l'expression de E-cadherin.Curieusement, la localisation de α-catenin a la contacte entre les cellules est indépendant de l'expression de E-cadherin.Au total, ses 5 résultats proposent que le E-cadherin fonction a réglé la distribution des protéines corticale pour encourager le compactage.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
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