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Enregistrement W6991879660

Insights into the hybridization occurring between the two molecular forms of the malaria mosquito Anopheles gambiae s.s

2013· article· en· W6991879660 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueIris (Roma Tre University) · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFisheries and Oceans CanadaAustrian Science FundUniversität HamburgKoninklijke Nederlandse Akademie van WetenschappenSlovenská Akadémia Vied
Mots-clésAnopheles gambiaeGenomeReproductive isolationIntrogressionMalariaGenetic divergenceTransposable elementGeneGene flowIncipient speciation
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Anopheles gambiae s.s., the most important mosquito species transmitting malaria in sub-Saharan Africa, is experiencing an incipient speciation process triggered by human-made environmental changes, which is changing malaria epidemiology. The species is subdivided into two molecular forms, named ‘M’ and ‘S’, defined on rDNA-IGS mutations and distinguished for the M form-specific insertion of a SINE transposable element (~1 Mb upstream from IGS). M and S forms represent a model for the study of speciation at its early stage since they are diversifying in West and Central Africa despite some ongoing gene flow. In fact, M and S present some genome regions which are supposed to resist introgression – especially in the low-recombinant centromeric areas of chromosomes X and 2 (‘speciation islands’) – while the rest of the genome continuously homogenise. The observed pattern rises questions on whether divergence is essentially due to physical features of the genome that reduce recombination (e.g., centromeres) despite gene flow, or to selection on adaptive genes clustered in the centromeric ‘speciation islands’ or elsewhere in the genome. Hybrids between M and S are rare in nature, but an unusually high degree of hybridization was found at the western extreme of their distribution range (i.e.The Gambia and Guinea Bissau). This secondary contact zone represents an opportunity to investigate how reduced reproductive isolation affects genetic differentiation in genomic regions known to be segregated between M and S forms elsewhere in Africa. While most studies focus on high-throughput SNPs assays on limited sampling, we genotyped a large number of A. gambiae s.s. specimens from Guinea Bissau (and from other African countries for comparison) focusing on two intronic regions known to segregate in sympatric M and S molecular forms out from the hybridization area: i) the intron-4 of a cytochrome P450, namely the Cyp4G16 gene, which 
\nmaps in the low recombination region of the X-centromere, ~7 kb upstream from SINE locus, and ii) the intron-1 of the voltage-gated sodium channel (VGSC) gene mapping on chromosome 2, out from the centromere area. Our results indicate that in the secondary contact zone recombination occurs within the most divergent region of M and S genome (i.e. the X-centromere), as highlighted by the intron-4 of Cyp4G16 data and support the hypothesis of asymmetric introgression from M to S, as shown by the analysis of intron-1 of VGSC gene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,596
Score d'incertitude au seuil0,272

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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