An investigation of saccharide complexation by aqueous oxoacids. Can oxoacids mediate A1-2 quorum sensing in bacteria?
Notice bibliographique
Résumé
The goal of this investigation was to determine whether it is plausible for bacterial AI-2 quorum sensing to be selectively regulated by environmentally available oxoacids. In particular, we investigated the ability of H2CO3 and H4SiO4 to bind molecules structurally analogous to the AI-2 signaling compound (a hydration product of (4S)-4,5-dihydroxy-2,3-pentanedione, S-DPD) which is known to be bound to H3BO3 in the AI-2 receptor site of V. harveyi. We report the first ever evidence of mono- and di-ester linked complexes formed spontaneously between carbonic acid and aqueous polyhydroxy hydrocarbons, providing support for the hypothesis that a complex between H2CO3 and some S-DPD derivative regulates AI-2 quorum sensing in S. gordonii. The carbonate centre in these novel complexes retains three-fold coordination. Additionally, we compared the binding affinity of silicic acid to that of boric acid and carbonic acid to several different alcohols and saccharides, and determined that the formation constants generally increase as H2CO3 < H4SiO4 < H3BO3. It seems entirely plausible, therefore, that silicic acid could modulate AI-2 quorum sensing in Sirich environments such as soil solutions. \nFinally, we determined that stannic acid is also complexed by a range of polyhydroxy hydrocarbons in aqueous solution and characterized of structures of many of the resulting mono-, bis- and tris-ligand complexes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».