Legionella- an underappreciated but important pathogen in HIV
Notice bibliographique
Résumé
People living with HIV (PLHIV) have increased susceptibility to respiratory pathogens such as Legionella, however, research on Legionella in community-acquired pneumonia (CAP) in PLHIV remains limited. This study aimed to determine the contribution that Legionella have on lung inflammation, dysfunction, and disease in this population. We hypothesized that Legionella infections occur commonly among patients with HIV+CAP, and that Legionella-infected individuals have more lung inflammation, lung dysfunction, and worse outcomes compared to Legionella-negative individuals. We investigated Legionella in two cohorts in Medellin, Colombia: The Discovery cohort, which comprised HIV+CAP patients, and the Validation cohort, which followed HIV, CAP, and HIV+CAP patients for 1 year. Blood and bronchoalveolar lavage (BAL), and blood, induced sputum, BAL, and spirometry were collected at study admission in the Discovery and Validation cohorts, respectively. Blood, induced sputum, and spirometry were also collected at 1, 6, and 12-month follow-ups. Sample aliquots were shipped to Canada for analyses. Legionella detection was assessed in respiratory samples using real-time PCR, bacterial cultures, and an amoeba model. To determine the effect of Legionella co-infection on clinical outcome, a patient database was consulted, comparing laboratory results and outcomes between Legionella positive and negative individuals. Bead-based technology was used to determine cytokine profiles associated with Legionella co-infection while spirometry results were used to assess how Legionella affects lung function. Data indicate that Legionella are frequently (>25%) found in respiratory samples of HIV+CAP co-infected individuals in Medellin, Colombia, and oftentimes are non-L. pneumophila SG1. Legionella co-infected individuals had higher rates of intensive care unit admissions, acute respiratory failure, and mortality compared to Legionella-negative individuals. At baseline, Legionella-infected individuals also had lower forced vital capacity % predicted, although lung function recovered over time. Additionally, markers of monocyte/macrophage activation and differentiation (Eotaxin, MCP-1 and, IP-10) associated with Legionella infection and with worse patient outcomes. Clinicians should be aware of the possible presence of Legionella in CAP in PLHIV and their potential role in disease severity as a misdiagnosis/lack of appropriate antibiotic coverage have the potential to be fatal. If further investigation supports these findings, this could change the way CAP is managed in this population.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».