Molecular characterization of ciprofloxacin resistant and/or beta-lactamase producing Escherichia coli from the Vancouver Coastal Health region
Notice bibliographique
Résumé
Emergent multidrug resistant Escherichia coli increase clinical challenges. This thesis describes the resistance patterns, molecular epidemiology and mechanisms, for 315 E. coli from patients in the Vancouver Coastal Health Region for 2006/2007. Automated susceptibility testing was confirmed via E-test® for AmpC and/or ESBL production. PFGE, RFLP and PCR were used to assess genotypic relationships, and plasmid character. AmpC production was facilitated mainly by promoter mutations (54.5%). The principal ESBL detected was CTX-M-15 (49.5%). An unidentified ESBL-producer, with a pI near 8.3, was detected. A plasmid displayed variant resistance phenotypes dependent on selective growth media. A positive correlation between ST131 with CTX-M-15 and CIPR indicated the dissemination of companion phenotypes. Ciprofloxacin resistance resulted mainly (98.0%) from a double gyrA mutation. Overall fluoroquinolone resistance was not assessable due to exclusive selection parameters in this evaluation. Fluoroquinolone resistance factors require further examination to understand what causes resistant phenotypes exclusive of chromosomal mutations. ii
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».