Molecular dynamics simulations of guest-host hydrogen bonding in structure I, II, and H clathrate hydrates
Notice bibliographique
Résumé
The standard picture is that clathrate hydrates form when hydrophobic guest molecules are compressed with water under high pressure-low temperature conditions. In the ice-like hydrate framework, water molecules form molecule-sized cavities that encapsulate the guests and minimize water-hydrophobic guest interactions. This picture, however, must be modified by observations that many water soluble, hydrogen- bonding molecules form hydrates under relatively mild pressure-temperature conditions as well. Furthermore, these hydrates form with the same canonical structures as hydrophobic guests. We recently performed a series of molecular dynamics simulations, single crystal X-ray crystallographic structural determinations, and NMR relaxation time experiments to explicitly study the presence of hydrogen bonds between the guest and host in clathrate hydrates. Systems studied include binary structure H hydrates of tertbutylmethylether and pinacolone, the binary structure II hydrates of tetrahydrofuran, tetrahydropyran, tert-butylamine, 1-propanol, 2-propanol, and ethanol and structure I hydrates of ethanol. These guests form hydrogen bonds of varying stability and lifetime which affect the hydrate structure and the dynamics of both the water host and the guests. Spectroscopic signatures of the guest-host hydrogen bonding are briefly discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».