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Enregistrement W6995838180

Plants, fungi, and freeloaders: Examining endophytic species richness changes over the growing season of Arceuthobium americanum

2016· article· en· W6995838180 sur OpenAlexfundaboutno aff

Notice bibliographique

RevueArca (British Columbia Electronic Library Network) · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Parasitism and Resistance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDirectorate for Biological SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaThompson Rivers University
Mots-clésSpecies richnessPlant use of endophytic fungi in defenseAbundance (ecology)Growing seasonCommon speciesBiodiversitySpecies diversity
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Arceuthobium americanum, or the lodgepole pine dwarf mistletoe, is a tree parasite in northern Canada. The plant has negatively impacted the lumber industry, causing significant financial losses, particularly in the west. Recently, endophytic fungi have been found in this plant, which have been discovered to function in protecting the plant from surface pathogens. The current study aimed to examine the endophytic fungi in more depth, looking for changes in species richness over the plant’s growing season and determining whether these richness changes differed between males and females. This information could yield a new management strategy, which would involve applying a surface pathogen spray at a time when the endophytic fungal diversity is lower and the plant is presumably more susceptible to pathogens.\nUsing pure culture techniques, endophytic fungi were isolated from surface sterilized A. americanum males and females weekly from the end of April to the beginning of September. Isolated fungi were characterized macroscopically to generate a database of morphologically unique forms that corresponded to individual species. Endophytic fungi that appeared consistently throughout the sampling period were sent to be sequenced by MACROGEN™ sequencing in Korea to determine their identities based on ITS rDNA sequences.\nThroughout the study period, 47 distinct morphological strains of fungi were isolated. Endophytic fungal species abundance was found to increase throughout the growing season in both males and female A. americanum plants. There was no significant difference in the species richness between males and females, and the two groups shared 87.5% species similarity based on Sørensen’s coefficient of similarity. Sequenced endophytes found in this study came from a diverse array of genera, including Trichoderma, Serpula, Alternaria, and Tremella, which may function as mutualistic symbionts within the plant. Endophytic fungal species richness follows the trend shown by all other plants to date: it increases throughout the growing season in new aerial shoots. Future work should aim to further characterize endophytic communities using metagenomic techniques and comparing endophyte communities of A. americanum to those of the host tree to see if there is crossover between the two organisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,996
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,167
Écart entre enseignants0,157 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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