Protein-protein regulation of calsequestrin expression in cardiomyocytes
Notice bibliographique
Résumé
Heart failure is the leading cause of death in both men and women of Western countries. The pathophysiology of heart failure is associated with abnormalities in intracellular calcium control. Calsequestrin (CSQ2), a calcium storage protein in cardiomyocytes, is negatively regulated by the transcription factor Egr-1 thus altering calcium availability for cardiac contraction/relaxation. Here, we tested the hypothesis that the proteins complexed to Egr-1 and/or their post-translational modifications would affect regulation of CSQ2 expression. Egr-1 and Sp1 compete for binding at the CSQ2 promoter, but also bind one another. In fact, together they form a complex with another ubiquitous transcription factor YBX-1. This complex was identified in vivo and in vitro by a series of co-immunoprecipitations. To test the idea that complex formation and CSQ2 expression could be affected by acetylation, histone acetyltransferase (HAT) inhibitors and histone deacetylase (HDAC) inhibitors were used to respectively decrease or increase acetylation within cells. We found that acetylation did not impact the formation of the Egr-1: Sp1: YBX-1 complex thought to regulate CSQ2 expression. However, changes in CSQ2 expression were observed when acetylation was modified by HAT and HDAC inhibitors. We conclude that acetylation modifies CSQ2 expression although not by means of the Egr-1: Sp1: YBX-1 complex even though Egr-1 is known to be acetylated.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».