PtpA and PknG Proteins Secreted by Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis are Recognized by Sera from Patients with Rheumatoid Arthritis: A Case–Control Study
Notice bibliographique
Résumé
Marco Bo,1 Gian Luca Erre,2 Horacio Bach,3 Yael N Slavin,3 Piera Angela Manchia,4 Giuseppe Passiu,2 Leonardo A Sechi1 1Department of Biomedical Sciences, Section of Microbiology and Virology, University of Sassari, Sassari 07100, Italy; 2Department of Clinical and Experimental Medicine, Azienda Ospedaliero-Universitaria di Sassari, UOC di Reumatologia, Sassari 07100, Italy; 3Division of Infectious Diseases, Faculty of Medicine, The University of British Columbia, Vancouver, BC V6H 3Z6, Canada; 4Centro Trasfusionale, AOU Sassari, Sassari, ItalyCorrespondence: Leonardo A SechiDepartment of Biomedical Sciences, University of Sassari, Viale San Pietro 43 B, Sassari 07100, ItalyTel +39 079228462Email sechila@uniss.itPurpose: Rheumatoid arthritis (RA) can result from complex interactions between the affected person’s genetic background and environment. Viral and bacterial infections may play a pathogenetic role in RA through different mechanisms of action. We aimed to evaluate the presence of antibodies (Abs) directed against two proteins of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP) in sera of RA subjects, which are crucial for the survival of the pathogen within macrophages. Moreover, we analyzed the correlation of immune response to both proteins with the following homologous peptides: BOLF1305–320, MAP_402718–32 and IRF5424–434 to understand how the synergic role of Epstein–Barr virus (EBV) and MAP infection in genetically predisposed subjects may lead to a possible deregulation of interferon regulatory factor 5 (IRF5).Materials and methods: The presence of Abs against protein tyrosine phosphatase A (PtpA) and protein kinase G (PknG) in sera from Sardinian RA patients (n=84) and healthy volunteers (HCs, n=79) was tested by indirect ELISA.Results: RA sera showed a remarkably high frequency of reactivity against PtpA in comparison to HCs (48.8% vs 7.6%; p<0.001) and lower but statistically significant responses towards PknG (27.4% vs 10.1%; p=0.0054). We found a significant linear correlation between the number of swollen joints and the concentrations of antibodies against PtpA (p=0.018). Furthermore, a significant bivariate correlation between PtpA and MAP MAP_402718–32 peptide has been found, suggesting that MAP infection may induce a secondary immune response through cross-reaction with IRF5 (R2=0.5).Conclusion: PtpA and PknG are strongly recognized in RA which supports the hypothesis that MAP infection may be involved in the pathogenesis of RA.Keywords: Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis, PtpA, PknG, virulence factors, rheumatoid arthritis, immune response
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».