The roles of NHE9 in vesicular trafficking and pH regulation
Notice bibliographique
Résumé
Alkali cation/proton exchangers (NHE/SLC9A family) are integral membrane transporters involved in both cellular and systemic pH regulation, among other functions.Members of this family share 25-68% protein sequence identity and vary in both their tissue distribution and subcellular localization.The NHE9 isoform is widely-expressed and present in a subset of early and recycling endosomes that are involved in cargo trafficking and signaling.Interestingly, numerous genetic and expression analyses have linked imbalances in NHE9 function to neurodevelopmental conditions, including autism and attention deficit/hyperactivity.Recent experiments indicate that NHE9 co-localizes with the AMPA receptor subunit GRIA1 in vesicles that traffic during long-term synaptic plasticity, a process that is thought to underlie learning and memory.Furthermore, a recent study using autism-associated variants of NHE9 has indicated that decreased NHE9 function leads to vesicular acidification and deficits in cargo trafficking.However, a detailed analysis of all autism-associated variants was not carried out.To this end, we analyzed the subcellular localization of NHE9 and its autism-associated variants, measured transferrin uptake into recycling endosomes by flow cytometry, and determined vesicular pH by fluorescence ratiometric imaging.None of the exogenously-expressed autism-associated variants mislocalized in HeLa or AP-1 cells.In disagreement with a previous report, we found that only the autism-associated variant Ser438Pro presented significant functional deficits.Moreover, we identified several putative interacting proteins of NHE9 by yeast two-hybrid screening of a human brain cDNA library.These data have begun to shed new insight into the mechanisms underlying the regulation of NHE9 and its involvement in neurodevelopmental disorders. Many of the interactions I have had during my study as a Master's student have made animpact.The tremendous change I see in myself (which hopefully has been for the better), as a researcher, as an individual, as a writer, as a teacher, and as a thinker, could not have been achieved without everything from casual quips to formal presentations.Despite my ambition, I do not want to attempt thanking everyone for everything.However, it's worth listing some key groups that have helped me during this degree.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».