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Enregistrement W6996309338

The roles of NHE9 in vesicular trafficking and pH regulation

2015· dissertation· en· W6996309338 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2015
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésEndosomeSynaptic vesicleSubcellular localizationTransferrin receptorVesicular transport proteinFunction (biology)Transport proteinBrefeldin AGene isoformProtein subunit
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alkali cation/proton exchangers (NHE/SLC9A family) are integral membrane transporters involved in both cellular and systemic pH regulation, among other functions. Members of this family share 25-68% protein sequence identity and vary in both their tissue distribution and subcellular localization. The NHE9 isoform is widely-expressed and present in a subset of early and recycling endosomes that are involved in cargo trafficking and signaling. Interestingly, numerous genetic and expression analyses have linked imbalances in NHE9 function to neurodevelopmental conditions, including autism and attention deficit/hyperactivity. Recent experiments indicate that NHE9 co-localizes with the AMPA receptor subunit GRIA1 in vesicles that traffic during long-term synaptic plasticity, a process that is thought to underlie learning and memory. Furthermore, a recent study using autism-associated variants of NHE9 has indicated that decreased NHE9 function leads to vesicular acidification and deficits in cargo trafficking. However, a detailed analysis of all autism-associated variants was not carried out. To this end, we analyzed the subcellular localization of NHE9 and its autism-associated variants, measured transferrin uptake into recycling endosomes by flow cytometry, and determined vesicular pH by fluorescence ratiometric imaging. None of the exogenously-expressed autism-associated variants mislocalized in HeLa or AP-1 cells. In disagreement with a previous report, we found that only the autism-associated variant Ser438Pro presented significant functional deficits. Moreover, we identified several putative interacting proteins of NHE9 by yeast two-hybrid screening of a human brain cDNA library. These data have begun to shed new insight into the mechanisms underlying the regulation of NHE9 and its involvement in neurodevelopmental disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,180
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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