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Enregistrement W6996535162

Selection among replicators and protocell chemotaxis

2019· dissertation· en· W6996535162 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueOxford University Research Archive (ORA) (University of Oxford) · 2019
Typedissertation
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueOrigins and Evolution of Life
Établissements canadiensTrinity College
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProtocellAutocatalysisAbiogenesisHomochiralityLiving systemsMechanism (biology)Model systemSelection (genetic algorithm)
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<p>This thesis describes a series of projects which have autocatalysis as the overarching theme. </p>\n\n<p>Chapter 1 is a general introduction to the construction of chemical models of biological systems. There is a discussion of what mechanisms are used to achieve autocatalysis. The biomimetic work of chapters 3 and 4 use lipid replicators, so there is particular focus on the physical autocatalysis of lipid aggregates and their use in prebiotic models. The roles that lipids play in life are used as an illustration of the promise they offer to systems chemists. A brief history of biological homochirality is given.</p>\n\n<p>Two designs for novel asymmetric autocatalytic reactions are described in chapter 2, both based on hydrogen bonding catalysis. Though neither system showed the desired amplification of chirality, this work led to the study of positive nonlinear effects within thiourea catalysis. </p>\n\n<p>Projects which attempt to couple lipid replication with protocell behaviour are presented in chapter 3. In this chapter oil droplets are used as simple model protocells. Interestingly, feedback between the motion of droplets and a lipid forming reaction are observed, with the system showing striking chemotaxis. In the second part of this chapter other systems are used to explore the relationship between lipid formation and compartment division.</p>\n\n<p>Chapter 4 describes observations relating to transient lipid replicators which can be fuelled to be maintained out of equilibrium. An initial finding shows that fuelling can result in dramatic oscillations, as well as stable concentrations. When lipids compete for resources, they typically show a succession through time, an interesting protocell model. Which replicating species dominates results from a multitude of combined effects which cannot be predicted simply using rates of formation of each lipid in isolation. </p>\n\n<p>Finally, chapter 5 outlines the conclusions that can be drawn from these results and what future work remains. </p>\n

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,720
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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