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Enregistrement W6996694692

Spy1: A Closer Look at its Binding Mutants

2024· article· en· W6996694692 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueScholarship at UWindsor (University of Windsor) · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCyclin-dependent kinaseMutantMutationSequence alignmentCyclin-dependent kinase 1ThiostreptonFungal proteinPeptide sequenceConserved sequence
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Breast cancer is the second leading cause of death from cancer among Canadian women, taking the lives of fourteen women each day in Canada. Spy1 (SPEEDY; RINGO) has been previously identified as a novel cell-cycle regulator that is elevated in many breast cancer patients, promoting progression through the cell-cycle and increased cell proliferation. Spy1 is an atypical, cyclin-like protein that is capable of binding directly to Cdk1 and Cdk2, activating their kinase activity to override cell-cycle checkpoints. Spy1 can also promote the degradation of p27, a Cdk inhibitor, through its phosphorylation and binding with Spy1. The mechanism by which Spy1 activates Cdks has been resolved using only Cdk2 and Spy1A, a single member within the Spy1 family. Mutation of D90 reduces binding to Cdk2, whereas the mutation of D97 and E135 on Spy1A were shown to impair the ability of Spy1 to activate Cdk2. Mutating the residues R170/174 and R179/180 reduced its binding with p27, leading to increased p27 expression. There is interest in determining whether these residues are conserved across Spy1 family members and further resolving the impact these mutations have on Spy1 function. We expressed these mutants in HEK-293 cells in the presence and absence of p27 to examine the effects of these mutants on cell growth and binding to its effectors. To investigate sequence homology between the different Spy1 family members, their amino acid sequences were aligned and compared using Basic Local Alignment Search Tool (BLAST). Future work can be done to examine whether the function of these sites is conserved across the family members. Given the involvement of Spy1 in many types of cancer, including more aggressive forms like triple negative breast cancer, the fulfillment of these objectives will provide a better understanding of the protein and the potential for it to be targeted in anti-cancer therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,120
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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