Spy1: A Closer Look at its Binding Mutants
Notice bibliographique
Résumé
Breast cancer is the second leading cause of death from cancer among Canadian women, taking the lives of fourteen women each day in Canada. Spy1 (SPEEDY; RINGO) has been previously identified as a novel cell-cycle regulator that is elevated in many breast cancer patients, promoting progression through the cell-cycle and increased cell proliferation. Spy1 is an atypical, cyclin-like protein that is capable of binding directly to Cdk1 and Cdk2, activating their kinase activity to override cell-cycle checkpoints. Spy1 can also promote the degradation of p27, a Cdk inhibitor, through its phosphorylation and binding with Spy1. The mechanism by which Spy1 activates Cdks has been resolved using only Cdk2 and Spy1A, a single member within the Spy1 family. Mutation of D90 reduces binding to Cdk2, whereas the mutation of D97 and E135 on Spy1A were shown to impair the ability of Spy1 to activate Cdk2. Mutating the residues R170/174 and R179/180 reduced its binding with p27, leading to increased p27 expression. There is interest in determining whether these residues are conserved across Spy1 family members and further resolving the impact these mutations have on Spy1 function. We expressed these mutants in HEK-293 cells in the presence and absence of p27 to examine the effects of these mutants on cell growth and binding to its effectors. To investigate sequence homology between the different Spy1 family members, their amino acid sequences were aligned and compared using Basic Local Alignment Search Tool (BLAST). Future work can be done to examine whether the function of these sites is conserved across the family members. Given the involvement of Spy1 in many types of cancer, including more aggressive forms like triple negative breast cancer, the fulfillment of these objectives will provide a better understanding of the protein and the potential for it to be targeted in anti-cancer therapies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».