Synchrotron infrared microspectroscopy of biological tissues: brain tissue from TgCRND8 Alzheimerâs disease mice and developing scar tissue in rats
Notice bibliographique
Résumé
Biological tissues were studied with synchrotron infrared (IR) microspectroscopy, a technique that allows the spatially resolved determination and mapping of multiple components in situ at high spatial resolution. The first project involved studying brain tissue from TgCRND8 mice, a transgenic model of Alzheimer’s disease (AD). AD is the main cause of dementia in the ageing population, marked by the deposition of plaques composed of the Aβ peptide. Dense-cored and diffuse plaques were IR mapped and the results correlated with histochemistry and immunostaining. Spectral analysis confirmed that congophilic plaque cores were composed of highly aggregated protein in a β-sheet conformation. The amide I maximum of plaque cores was 1623 cm-1; there was no evidence of the high frequency (1680-1690 cm-1) peak seen in in vitro Aβ fibrils and attributed to anti-parallel β-sheet. A significant elevation in phospholipids was found around dense-cored plaques in TgCRND8 mice ranging in age from 5 to 21 months. This was due to an increase in cellular membranes from dystrophic neurites and glial cells around the core, but could also contribute to Aβ aggregation through the interaction of newly secreted Aβ with phospholipids. In contrast, diffuse plaques were not associated with infrared detectable changes in protein secondary structure or relative concentrations of other tissue components. In addition, focally elevated deposits of creatine, a molecule with a crucial role in energy metabolism, were discovered in AD brain tissue with IR microspectroscopy. The creatine deposits may be a previously undiscovered disease marker. A second project was part of a larger Natural Sciences and Engineering Research Council Collaborative Health Research Project (NSERC-CHRP) to test the hypothesis that treatment with anti-oxidants, L-2-oxo-thiazolidine-4-carboxylate (OTC) and quercetin, following spinal surgery may reduce oxidative stress, inflammation, and scarring. The effect of OTC and quercetin on scar tissue formation was evaluated in rats that had undergone laminectomy. Synchrotron IR microspectroscopy data were collected on scar tissue from OTC, quercetin and saline (control) treated animals, sacrificed at 3 and 21 days post-surgery. Spectral differences could be correlated with the stages of wound healing.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».